Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP38

Cracr2a, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cracr2aQ3UP38 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cracr2aQ3UP38 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cracr2aQ3UP38 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cracr2aQ3UP38 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cracr2aQ3UP38 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cracr2aQ3UP38 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cracr2aQ3UP38 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cracr2aQ3UP38 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Cracr2aQ3UP38 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cracr2aQ3UP38 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cracr2aQ3UP38 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cracr2aQ3UP38 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cracr2aQ3UP38 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cracr2aQ3UP38 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cracr2aQ3UP38 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cracr2aQ3UP38 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cracr2aQ3UP38 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cracr2aQ3UP38 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cracr2aQ3UP38 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Cracr2aQ3UP38 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cracr2aQ3UP38 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cracr2aQ3UP38 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Cracr2aQ3UP38 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cracr2aQ3UP38 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Cracr2aQ3UP38 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cracr2aQ3UP38 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cracr2aQ3UP38 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cracr2aQ3UP38 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cracr2aQ3UP38 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cracr2aQ3UP38 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cracr2aQ3UP38 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cracr2aQ3UP38 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cracr2aQ3UP38 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cracr2aQ3UP38 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cracr2aQ3UP38 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cracr2aQ3UP38 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Cracr2aQ3UP38 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cracr2aQ3UP38 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cracr2aQ3UP38 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cracr2aQ3UP38 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cracr2aQ3UP38 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Cracr2aQ3UP38 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cracr2aQ3UP38 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cracr2aQ3UP38 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cracr2aQ3UP38 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cracr2aQ3UP38 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cracr2aQ3UP38 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cracr2aQ3UP38 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cracr2aQ3UP38 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cracr2aQ3UP38 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cracr2aQ3UP38 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cracr2aQ3UP38 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Cracr2aQ3UP38 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cracr2aQ3UP38 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cracr2aQ3UP38 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cracr2aQ3UP38 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cracr2aQ3UP38 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cracr2aQ3UP38 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cracr2aQ3UP38 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cracr2aQ3UP38 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cracr2aQ3UP38 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cracr2aQ3UP38 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cracr2aQ3UP38 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cracr2aQ3UP38 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cracr2aQ3UP38 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cracr2aQ3UP38 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cracr2aQ3UP38 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cracr2aQ3UP38 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cracr2aQ3UP38 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cracr2aQ3UP38 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cracr2aQ3UP38 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Cracr2aQ3UP38 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cracr2aQ3UP38 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cracr2aQ3UP38 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cracr2aQ3UP38 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cracr2aQ3UP38 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cracr2aQ3UP38 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cracr2aQ3UP38 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cracr2aQ3UP38 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cracr2aQ3UP38 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cracr2aQ3UP38 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cracr2aQ3UP38 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cracr2aQ3UP38 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cracr2aQ3UP38 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cracr2aQ3UP38 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cracr2aQ3UP38 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cracr2aQ3UP38 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cracr2aQ3UP38 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cracr2aQ3UP38 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cracr2aQ3UP38 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cracr2aQ3UP38 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cracr2aQ3UP38 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cracr2aQ3UP38 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cracr2aQ3UP38 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cracr2aQ3UP38 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cracr2aQ3UP38 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cracr2aQ3UP38 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cracr2aQ3UP38 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cracr2aQ3UP38 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cracr2aQ3UP38 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77 ms