Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp30Q3UN04 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp30Q3UN04 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp30Q3UN04 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp30Q3UN04 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp30Q3UN04 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp30Q3UN04 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp30Q3UN04 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp30Q3UN04 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp30Q3UN04 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp30Q3UN04 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp30Q3UN04 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp30Q3UN04 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp30Q3UN04 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp30Q3UN04 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp30Q3UN04 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp30Q3UN04 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp30Q3UN04 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Usp30Q3UN04 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp30Q3UN04 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp30Q3UN04 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp30Q3UN04 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp30Q3UN04 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp30Q3UN04 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp30Q3UN04 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp30Q3UN04 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp30Q3UN04 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp30Q3UN04 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp30Q3UN04 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp30Q3UN04 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp30Q3UN04 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp30Q3UN04 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp30Q3UN04 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp30Q3UN04 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp30Q3UN04 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp30Q3UN04 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp30Q3UN04 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp30Q3UN04 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp30Q3UN04 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp30Q3UN04 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp30Q3UN04 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp30Q3UN04 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp30Q3UN04 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp30Q3UN04 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp30Q3UN04 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp30Q3UN04 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp30Q3UN04 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp30Q3UN04 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp30Q3UN04 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp30Q3UN04 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp30Q3UN04 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp30Q3UN04 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp30Q3UN04 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp30Q3UN04 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp30Q3UN04 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp30Q3UN04 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp30Q3UN04 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp30Q3UN04 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp30Q3UN04 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp30Q3UN04 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp30Q3UN04 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp30Q3UN04 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp30Q3UN04 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp30Q3UN04 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp30Q3UN04 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp30Q3UN04 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp30Q3UN04 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp30Q3UN04 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp30Q3UN04 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp30Q3UN04 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp30Q3UN04 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp30Q3UN04 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp30Q3UN04 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp30Q3UN04 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Usp30Q3UN04 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp30Q3UN04 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp30Q3UN04 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp30Q3UN04 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp30Q3UN04 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp30Q3UN04 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp30Q3UN04 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp30Q3UN04 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp30Q3UN04 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Usp30Q3UN04 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp30Q3UN04 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Usp30Q3UN04 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Usp30Q3UN04 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp30Q3UN04 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp30Q3UN04 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Usp30Q3UN04 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp30Q3UN04 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp30Q3UN04 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp30Q3UN04 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp30Q3UN04 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Usp30Q3UN04 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp30Q3UN04 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp30Q3UN04 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp30Q3UN04 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp30Q3UN04 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Usp30Q3UN04 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 159.7 ms