Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Hdgfl2Q3UMU9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hdgfl2Q3UMU9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hdgfl2Q3UMU9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hdgfl2Q3UMU9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Hdgfl2Q3UMU9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hdgfl2Q3UMU9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hdgfl2Q3UMU9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hdgfl2Q3UMU9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hdgfl2Q3UMU9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hdgfl2Q3UMU9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hdgfl2Q3UMU9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hdgfl2Q3UMU9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hdgfl2Q3UMU9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hdgfl2Q3UMU9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hdgfl2Q3UMU9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hdgfl2Q3UMU9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hdgfl2Q3UMU9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Hdgfl2Q3UMU9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hdgfl2Q3UMU9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hdgfl2Q3UMU9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hdgfl2Q3UMU9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hdgfl2Q3UMU9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hdgfl2Q3UMU9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hdgfl2Q3UMU9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hdgfl2Q3UMU9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Hdgfl2Q3UMU9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hdgfl2Q3UMU9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hdgfl2Q3UMU9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hdgfl2Q3UMU9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hdgfl2Q3UMU9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hdgfl2Q3UMU9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hdgfl2Q3UMU9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Hdgfl2Q3UMU9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hdgfl2Q3UMU9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hdgfl2Q3UMU9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hdgfl2Q3UMU9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hdgfl2Q3UMU9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hdgfl2Q3UMU9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hdgfl2Q3UMU9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hdgfl2Q3UMU9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hdgfl2Q3UMU9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hdgfl2Q3UMU9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hdgfl2Q3UMU9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hdgfl2Q3UMU9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hdgfl2Q3UMU9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hdgfl2Q3UMU9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hdgfl2Q3UMU9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hdgfl2Q3UMU9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hdgfl2Q3UMU9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hdgfl2Q3UMU9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hdgfl2Q3UMU9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hdgfl2Q3UMU9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hdgfl2Q3UMU9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hdgfl2Q3UMU9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hdgfl2Q3UMU9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hdgfl2Q3UMU9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hdgfl2Q3UMU9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hdgfl2Q3UMU9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hdgfl2Q3UMU9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hdgfl2Q3UMU9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hdgfl2Q3UMU9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hdgfl2Q3UMU9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hdgfl2Q3UMU9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Hdgfl2Q3UMU9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Hdgfl2Q3UMU9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Hdgfl2Q3UMU9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Hdgfl2Q3UMU9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hdgfl2Q3UMU9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hdgfl2Q3UMU9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hdgfl2Q3UMU9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hdgfl2Q3UMU9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hdgfl2Q3UMU9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hdgfl2Q3UMU9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hdgfl2Q3UMU9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hdgfl2Q3UMU9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hdgfl2Q3UMU9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hdgfl2Q3UMU9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hdgfl2Q3UMU9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hdgfl2Q3UMU9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hdgfl2Q3UMU9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Hdgfl2Q3UMU9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hdgfl2Q3UMU9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hdgfl2Q3UMU9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hdgfl2Q3UMU9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hdgfl2Q3UMU9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hdgfl2Q3UMU9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hdgfl2Q3UMU9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hdgfl2Q3UMU9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hdgfl2Q3UMU9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hdgfl2Q3UMU9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hdgfl2Q3UMU9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Hdgfl2Q3UMU9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hdgfl2Q3UMU9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hdgfl2Q3UMU9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hdgfl2Q3UMU9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hdgfl2Q3UMU9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hdgfl2Q3UMU9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms