Protein–RNA interactions for Protein: Q3UME2

Tmem241, Transmembrane protein 241, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem241Q3UME2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem241Q3UME2 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem241Q3UME2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem241Q3UME2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem241Q3UME2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem241Q3UME2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem241Q3UME2 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem241Q3UME2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem241Q3UME2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem241Q3UME2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem241Q3UME2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem241Q3UME2 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem241Q3UME2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem241Q3UME2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem241Q3UME2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem241Q3UME2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmem241Q3UME2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmem241Q3UME2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem241Q3UME2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem241Q3UME2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem241Q3UME2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem241Q3UME2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem241Q3UME2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem241Q3UME2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem241Q3UME2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem241Q3UME2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem241Q3UME2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem241Q3UME2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem241Q3UME2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem241Q3UME2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem241Q3UME2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem241Q3UME2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem241Q3UME2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem241Q3UME2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem241Q3UME2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem241Q3UME2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem241Q3UME2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem241Q3UME2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem241Q3UME2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem241Q3UME2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem241Q3UME2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem241Q3UME2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem241Q3UME2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem241Q3UME2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem241Q3UME2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem241Q3UME2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem241Q3UME2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem241Q3UME2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem241Q3UME2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem241Q3UME2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem241Q3UME2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmem241Q3UME2 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem241Q3UME2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem241Q3UME2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem241Q3UME2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem241Q3UME2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem241Q3UME2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem241Q3UME2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem241Q3UME2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmem241Q3UME2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmem241Q3UME2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmem241Q3UME2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem241Q3UME2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem241Q3UME2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem241Q3UME2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem241Q3UME2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem241Q3UME2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem241Q3UME2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem241Q3UME2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem241Q3UME2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem241Q3UME2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem241Q3UME2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem241Q3UME2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem241Q3UME2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem241Q3UME2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem241Q3UME2 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem241Q3UME2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem241Q3UME2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem241Q3UME2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem241Q3UME2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem241Q3UME2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem241Q3UME2 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem241Q3UME2 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem241Q3UME2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem241Q3UME2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem241Q3UME2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem241Q3UME2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem241Q3UME2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem241Q3UME2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem241Q3UME2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem241Q3UME2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmem241Q3UME2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem241Q3UME2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem241Q3UME2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem241Q3UME2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmem241Q3UME2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem241Q3UME2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem241Q3UME2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem241Q3UME2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmem241Q3UME2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms