Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULA2

Btrc, F-box/WD repeat-containing protein 1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 605 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BtrcQ3ULA2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BtrcQ3ULA2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BtrcQ3ULA2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
BtrcQ3ULA2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BtrcQ3ULA2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BtrcQ3ULA2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BtrcQ3ULA2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BtrcQ3ULA2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BtrcQ3ULA2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BtrcQ3ULA2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BtrcQ3ULA2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BtrcQ3ULA2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BtrcQ3ULA2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BtrcQ3ULA2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BtrcQ3ULA2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BtrcQ3ULA2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BtrcQ3ULA2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BtrcQ3ULA2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BtrcQ3ULA2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BtrcQ3ULA2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BtrcQ3ULA2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BtrcQ3ULA2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BtrcQ3ULA2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BtrcQ3ULA2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BtrcQ3ULA2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BtrcQ3ULA2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BtrcQ3ULA2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BtrcQ3ULA2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BtrcQ3ULA2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BtrcQ3ULA2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BtrcQ3ULA2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BtrcQ3ULA2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.03
BtrcQ3ULA2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
BtrcQ3ULA2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
BtrcQ3ULA2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BtrcQ3ULA2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BtrcQ3ULA2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BtrcQ3ULA2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BtrcQ3ULA2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BtrcQ3ULA2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BtrcQ3ULA2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BtrcQ3ULA2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BtrcQ3ULA2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BtrcQ3ULA2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BtrcQ3ULA2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BtrcQ3ULA2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
BtrcQ3ULA2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BtrcQ3ULA2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BtrcQ3ULA2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BtrcQ3ULA2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BtrcQ3ULA2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BtrcQ3ULA2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BtrcQ3ULA2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
BtrcQ3ULA2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BtrcQ3ULA2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BtrcQ3ULA2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BtrcQ3ULA2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BtrcQ3ULA2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BtrcQ3ULA2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BtrcQ3ULA2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
BtrcQ3ULA2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BtrcQ3ULA2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BtrcQ3ULA2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BtrcQ3ULA2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BtrcQ3ULA2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BtrcQ3ULA2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BtrcQ3ULA2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BtrcQ3ULA2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
BtrcQ3ULA2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BtrcQ3ULA2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BtrcQ3ULA2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BtrcQ3ULA2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BtrcQ3ULA2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BtrcQ3ULA2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BtrcQ3ULA2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BtrcQ3ULA2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BtrcQ3ULA2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BtrcQ3ULA2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BtrcQ3ULA2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BtrcQ3ULA2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BtrcQ3ULA2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BtrcQ3ULA2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BtrcQ3ULA2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BtrcQ3ULA2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BtrcQ3ULA2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BtrcQ3ULA2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
BtrcQ3ULA2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BtrcQ3ULA2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BtrcQ3ULA2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
BtrcQ3ULA2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
BtrcQ3ULA2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BtrcQ3ULA2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BtrcQ3ULA2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BtrcQ3ULA2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BtrcQ3ULA2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BtrcQ3ULA2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BtrcQ3ULA2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BtrcQ3ULA2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BtrcQ3ULA2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BtrcQ3ULA2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms