Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKU4

Fam83f, Protein FAM83F, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam83fQ3UKU4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam83fQ3UKU4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam83fQ3UKU4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam83fQ3UKU4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam83fQ3UKU4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam83fQ3UKU4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam83fQ3UKU4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam83fQ3UKU4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam83fQ3UKU4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam83fQ3UKU4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam83fQ3UKU4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam83fQ3UKU4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam83fQ3UKU4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam83fQ3UKU4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam83fQ3UKU4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam83fQ3UKU4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam83fQ3UKU4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam83fQ3UKU4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam83fQ3UKU4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam83fQ3UKU4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam83fQ3UKU4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam83fQ3UKU4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam83fQ3UKU4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam83fQ3UKU4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam83fQ3UKU4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam83fQ3UKU4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam83fQ3UKU4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam83fQ3UKU4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam83fQ3UKU4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam83fQ3UKU4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam83fQ3UKU4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam83fQ3UKU4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam83fQ3UKU4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam83fQ3UKU4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam83fQ3UKU4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam83fQ3UKU4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fam83fQ3UKU4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam83fQ3UKU4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam83fQ3UKU4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam83fQ3UKU4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam83fQ3UKU4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam83fQ3UKU4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam83fQ3UKU4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam83fQ3UKU4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam83fQ3UKU4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam83fQ3UKU4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam83fQ3UKU4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam83fQ3UKU4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam83fQ3UKU4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam83fQ3UKU4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam83fQ3UKU4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam83fQ3UKU4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam83fQ3UKU4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam83fQ3UKU4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam83fQ3UKU4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam83fQ3UKU4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam83fQ3UKU4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam83fQ3UKU4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam83fQ3UKU4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam83fQ3UKU4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam83fQ3UKU4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam83fQ3UKU4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam83fQ3UKU4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam83fQ3UKU4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam83fQ3UKU4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam83fQ3UKU4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam83fQ3UKU4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam83fQ3UKU4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam83fQ3UKU4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam83fQ3UKU4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam83fQ3UKU4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam83fQ3UKU4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam83fQ3UKU4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam83fQ3UKU4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam83fQ3UKU4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam83fQ3UKU4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam83fQ3UKU4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam83fQ3UKU4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam83fQ3UKU4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam83fQ3UKU4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam83fQ3UKU4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam83fQ3UKU4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam83fQ3UKU4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam83fQ3UKU4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam83fQ3UKU4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam83fQ3UKU4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam83fQ3UKU4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam83fQ3UKU4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam83fQ3UKU4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam83fQ3UKU4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fam83fQ3UKU4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fam83fQ3UKU4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fam83fQ3UKU4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fam83fQ3UKU4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fam83fQ3UKU4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fam83fQ3UKU4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fam83fQ3UKU4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fam83fQ3UKU4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam83fQ3UKU4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam83fQ3UKU4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118 ms