Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKU1

Ell2, RNA polymerase II elongation factor ELL2, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell2Q3UKU1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Ell2Q3UKU1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ell2Q3UKU1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ell2Q3UKU1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ell2Q3UKU1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ell2Q3UKU1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ell2Q3UKU1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ell2Q3UKU1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ell2Q3UKU1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ell2Q3UKU1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ell2Q3UKU1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ell2Q3UKU1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ell2Q3UKU1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ell2Q3UKU1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Ell2Q3UKU1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ell2Q3UKU1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ell2Q3UKU1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ell2Q3UKU1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ell2Q3UKU1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ell2Q3UKU1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Ell2Q3UKU1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ell2Q3UKU1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ell2Q3UKU1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ell2Q3UKU1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ell2Q3UKU1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ell2Q3UKU1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ell2Q3UKU1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Ell2Q3UKU1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ell2Q3UKU1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ell2Q3UKU1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ell2Q3UKU1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ell2Q3UKU1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Ell2Q3UKU1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ell2Q3UKU1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ell2Q3UKU1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ell2Q3UKU1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ell2Q3UKU1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ell2Q3UKU1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ell2Q3UKU1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ell2Q3UKU1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ell2Q3UKU1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ell2Q3UKU1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ell2Q3UKU1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ell2Q3UKU1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ell2Q3UKU1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ell2Q3UKU1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ell2Q3UKU1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ell2Q3UKU1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ell2Q3UKU1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ell2Q3UKU1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ell2Q3UKU1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ell2Q3UKU1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ell2Q3UKU1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ell2Q3UKU1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ell2Q3UKU1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ell2Q3UKU1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ell2Q3UKU1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ell2Q3UKU1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ell2Q3UKU1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ell2Q3UKU1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ell2Q3UKU1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ell2Q3UKU1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ell2Q3UKU1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ell2Q3UKU1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ell2Q3UKU1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Ell2Q3UKU1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ell2Q3UKU1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ell2Q3UKU1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ell2Q3UKU1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ell2Q3UKU1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ell2Q3UKU1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ell2Q3UKU1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ell2Q3UKU1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ell2Q3UKU1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ell2Q3UKU1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ell2Q3UKU1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ell2Q3UKU1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ell2Q3UKU1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ell2Q3UKU1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ell2Q3UKU1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ell2Q3UKU1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ell2Q3UKU1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ell2Q3UKU1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ell2Q3UKU1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ell2Q3UKU1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ell2Q3UKU1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ell2Q3UKU1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ell2Q3UKU1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ell2Q3UKU1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ell2Q3UKU1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ell2Q3UKU1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ell2Q3UKU1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ell2Q3UKU1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ell2Q3UKU1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Ell2Q3UKU1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ell2Q3UKU1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ell2Q3UKU1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ell2Q3UKU1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ell2Q3UKU1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ell2Q3UKU1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms