Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKJ7

Smu1, WD40 repeat-containing protein SMU1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smu1Q3UKJ7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smu1Q3UKJ7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smu1Q3UKJ7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Smu1Q3UKJ7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smu1Q3UKJ7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smu1Q3UKJ7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Smu1Q3UKJ7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smu1Q3UKJ7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smu1Q3UKJ7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smu1Q3UKJ7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smu1Q3UKJ7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smu1Q3UKJ7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smu1Q3UKJ7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Smu1Q3UKJ7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smu1Q3UKJ7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smu1Q3UKJ7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smu1Q3UKJ7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smu1Q3UKJ7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smu1Q3UKJ7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smu1Q3UKJ7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smu1Q3UKJ7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smu1Q3UKJ7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smu1Q3UKJ7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smu1Q3UKJ7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smu1Q3UKJ7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smu1Q3UKJ7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smu1Q3UKJ7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smu1Q3UKJ7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Smu1Q3UKJ7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smu1Q3UKJ7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smu1Q3UKJ7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smu1Q3UKJ7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Smu1Q3UKJ7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Smu1Q3UKJ7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smu1Q3UKJ7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smu1Q3UKJ7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smu1Q3UKJ7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smu1Q3UKJ7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smu1Q3UKJ7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smu1Q3UKJ7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smu1Q3UKJ7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smu1Q3UKJ7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smu1Q3UKJ7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smu1Q3UKJ7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smu1Q3UKJ7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smu1Q3UKJ7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Smu1Q3UKJ7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smu1Q3UKJ7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smu1Q3UKJ7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smu1Q3UKJ7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smu1Q3UKJ7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Smu1Q3UKJ7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smu1Q3UKJ7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smu1Q3UKJ7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smu1Q3UKJ7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smu1Q3UKJ7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smu1Q3UKJ7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smu1Q3UKJ7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smu1Q3UKJ7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smu1Q3UKJ7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smu1Q3UKJ7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smu1Q3UKJ7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smu1Q3UKJ7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smu1Q3UKJ7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smu1Q3UKJ7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smu1Q3UKJ7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smu1Q3UKJ7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smu1Q3UKJ7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smu1Q3UKJ7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smu1Q3UKJ7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smu1Q3UKJ7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Smu1Q3UKJ7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Smu1Q3UKJ7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Smu1Q3UKJ7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smu1Q3UKJ7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smu1Q3UKJ7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smu1Q3UKJ7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smu1Q3UKJ7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smu1Q3UKJ7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smu1Q3UKJ7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smu1Q3UKJ7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smu1Q3UKJ7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smu1Q3UKJ7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smu1Q3UKJ7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smu1Q3UKJ7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smu1Q3UKJ7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smu1Q3UKJ7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smu1Q3UKJ7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smu1Q3UKJ7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smu1Q3UKJ7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smu1Q3UKJ7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smu1Q3UKJ7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smu1Q3UKJ7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smu1Q3UKJ7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Smu1Q3UKJ7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Smu1Q3UKJ7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Smu1Q3UKJ7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Smu1Q3UKJ7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Smu1Q3UKJ7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Smu1Q3UKJ7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms