Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHJ8

Rnf44, RING finger protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf44Q3UHJ8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf44Q3UHJ8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf44Q3UHJ8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf44Q3UHJ8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf44Q3UHJ8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf44Q3UHJ8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf44Q3UHJ8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf44Q3UHJ8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf44Q3UHJ8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf44Q3UHJ8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnf44Q3UHJ8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnf44Q3UHJ8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnf44Q3UHJ8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnf44Q3UHJ8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnf44Q3UHJ8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnf44Q3UHJ8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnf44Q3UHJ8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnf44Q3UHJ8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnf44Q3UHJ8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnf44Q3UHJ8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnf44Q3UHJ8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnf44Q3UHJ8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rnf44Q3UHJ8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rnf44Q3UHJ8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rnf44Q3UHJ8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rnf44Q3UHJ8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rnf44Q3UHJ8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rnf44Q3UHJ8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rnf44Q3UHJ8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rnf44Q3UHJ8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Rnf44Q3UHJ8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rnf44Q3UHJ8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rnf44Q3UHJ8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rnf44Q3UHJ8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rnf44Q3UHJ8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rnf44Q3UHJ8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rnf44Q3UHJ8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.32■■□□□ 1
Rnf44Q3UHJ8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rnf44Q3UHJ8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rnf44Q3UHJ8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rnf44Q3UHJ8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rnf44Q3UHJ8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rnf44Q3UHJ8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rnf44Q3UHJ8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rnf44Q3UHJ8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rnf44Q3UHJ8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rnf44Q3UHJ8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rnf44Q3UHJ8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rnf44Q3UHJ8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Rnf44Q3UHJ8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rnf44Q3UHJ8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rnf44Q3UHJ8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf44Q3UHJ8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf44Q3UHJ8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf44Q3UHJ8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf44Q3UHJ8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf44Q3UHJ8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf44Q3UHJ8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf44Q3UHJ8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rnf44Q3UHJ8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rnf44Q3UHJ8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rnf44Q3UHJ8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Rnf44Q3UHJ8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rnf44Q3UHJ8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rnf44Q3UHJ8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnf44Q3UHJ8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnf44Q3UHJ8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnf44Q3UHJ8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnf44Q3UHJ8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnf44Q3UHJ8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnf44Q3UHJ8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnf44Q3UHJ8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Rnf44Q3UHJ8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rnf44Q3UHJ8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rnf44Q3UHJ8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rnf44Q3UHJ8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rnf44Q3UHJ8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rnf44Q3UHJ8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rnf44Q3UHJ8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rnf44Q3UHJ8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rnf44Q3UHJ8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rnf44Q3UHJ8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rnf44Q3UHJ8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rnf44Q3UHJ8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rnf44Q3UHJ8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rnf44Q3UHJ8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rnf44Q3UHJ8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rnf44Q3UHJ8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rnf44Q3UHJ8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rnf44Q3UHJ8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rnf44Q3UHJ8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rnf44Q3UHJ8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rnf44Q3UHJ8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rnf44Q3UHJ8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rnf44Q3UHJ8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rnf44Q3UHJ8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rnf44Q3UHJ8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rnf44Q3UHJ8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rnf44Q3UHJ8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Rnf44Q3UHJ8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms