Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHI4

Tmed8, Protein TMED8, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed8Q3UHI4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tmed8Q3UHI4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tmed8Q3UHI4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tmed8Q3UHI4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tmed8Q3UHI4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tmed8Q3UHI4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tmed8Q3UHI4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tmed8Q3UHI4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Tmed8Q3UHI4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tmed8Q3UHI4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tmed8Q3UHI4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tmed8Q3UHI4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tmed8Q3UHI4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tmed8Q3UHI4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Tmed8Q3UHI4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tmed8Q3UHI4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tmed8Q3UHI4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tmed8Q3UHI4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tmed8Q3UHI4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Tmed8Q3UHI4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tmed8Q3UHI4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tmed8Q3UHI4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Tmed8Q3UHI4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tmed8Q3UHI4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tmed8Q3UHI4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tmed8Q3UHI4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tmed8Q3UHI4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Tmed8Q3UHI4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tmed8Q3UHI4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tmed8Q3UHI4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tmed8Q3UHI4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Tmed8Q3UHI4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tmed8Q3UHI4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tmed8Q3UHI4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tmed8Q3UHI4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tmed8Q3UHI4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tmed8Q3UHI4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tmed8Q3UHI4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tmed8Q3UHI4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tmed8Q3UHI4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tmed8Q3UHI4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tmed8Q3UHI4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tmed8Q3UHI4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tmed8Q3UHI4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tmed8Q3UHI4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tmed8Q3UHI4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tmed8Q3UHI4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tmed8Q3UHI4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Tmed8Q3UHI4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tmed8Q3UHI4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tmed8Q3UHI4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tmed8Q3UHI4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tmed8Q3UHI4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tmed8Q3UHI4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tmed8Q3UHI4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tmed8Q3UHI4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tmed8Q3UHI4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Tmed8Q3UHI4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tmed8Q3UHI4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tmed8Q3UHI4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tmed8Q3UHI4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tmed8Q3UHI4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tmed8Q3UHI4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tmed8Q3UHI4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tmed8Q3UHI4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tmed8Q3UHI4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tmed8Q3UHI4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tmed8Q3UHI4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tmed8Q3UHI4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tmed8Q3UHI4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tmed8Q3UHI4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tmed8Q3UHI4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tmed8Q3UHI4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tmed8Q3UHI4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tmed8Q3UHI4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Tmed8Q3UHI4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tmed8Q3UHI4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tmed8Q3UHI4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tmed8Q3UHI4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tmed8Q3UHI4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tmed8Q3UHI4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tmed8Q3UHI4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tmed8Q3UHI4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tmed8Q3UHI4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tmed8Q3UHI4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tmed8Q3UHI4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tmed8Q3UHI4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tmed8Q3UHI4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tmed8Q3UHI4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tmed8Q3UHI4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tmed8Q3UHI4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tmed8Q3UHI4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tmed8Q3UHI4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tmed8Q3UHI4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tmed8Q3UHI4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tmed8Q3UHI4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tmed8Q3UHI4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tmed8Q3UHI4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tmed8Q3UHI4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tmed8Q3UHI4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 135.2 ms