Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snx27Q3UHD6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snx27Q3UHD6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snx27Q3UHD6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Snx27Q3UHD6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Snx27Q3UHD6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Snx27Q3UHD6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Snx27Q3UHD6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Snx27Q3UHD6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Snx27Q3UHD6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Snx27Q3UHD6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Snx27Q3UHD6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Snx27Q3UHD6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snx27Q3UHD6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snx27Q3UHD6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snx27Q3UHD6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snx27Q3UHD6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snx27Q3UHD6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snx27Q3UHD6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Snx27Q3UHD6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Snx27Q3UHD6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Snx27Q3UHD6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Snx27Q3UHD6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Snx27Q3UHD6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Snx27Q3UHD6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Snx27Q3UHD6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Snx27Q3UHD6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Snx27Q3UHD6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Snx27Q3UHD6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Snx27Q3UHD6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Snx27Q3UHD6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Snx27Q3UHD6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Snx27Q3UHD6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Snx27Q3UHD6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Snx27Q3UHD6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Snx27Q3UHD6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Snx27Q3UHD6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Snx27Q3UHD6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Snx27Q3UHD6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Snx27Q3UHD6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Snx27Q3UHD6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Snx27Q3UHD6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Snx27Q3UHD6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Snx27Q3UHD6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Snx27Q3UHD6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Snx27Q3UHD6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Snx27Q3UHD6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Snx27Q3UHD6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Snx27Q3UHD6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Snx27Q3UHD6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Snx27Q3UHD6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Snx27Q3UHD6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Snx27Q3UHD6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Snx27Q3UHD6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Snx27Q3UHD6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Snx27Q3UHD6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Snx27Q3UHD6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Snx27Q3UHD6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Snx27Q3UHD6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Snx27Q3UHD6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Snx27Q3UHD6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Snx27Q3UHD6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Snx27Q3UHD6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Snx27Q3UHD6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Snx27Q3UHD6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Snx27Q3UHD6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Snx27Q3UHD6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Snx27Q3UHD6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Snx27Q3UHD6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Snx27Q3UHD6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Snx27Q3UHD6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Snx27Q3UHD6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Snx27Q3UHD6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Snx27Q3UHD6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Snx27Q3UHD6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Snx27Q3UHD6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Snx27Q3UHD6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Snx27Q3UHD6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Snx27Q3UHD6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Snx27Q3UHD6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Snx27Q3UHD6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Snx27Q3UHD6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Snx27Q3UHD6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Snx27Q3UHD6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Snx27Q3UHD6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Snx27Q3UHD6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Snx27Q3UHD6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Snx27Q3UHD6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Snx27Q3UHD6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Snx27Q3UHD6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Snx27Q3UHD6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Snx27Q3UHD6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Snx27Q3UHD6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Snx27Q3UHD6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Snx27Q3UHD6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Snx27Q3UHD6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Snx27Q3UHD6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Snx27Q3UHD6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Snx27Q3UHD6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Snx27Q3UHD6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms