Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFQ8

Carmil3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil3Q3UFQ8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Carmil3Q3UFQ8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Carmil3Q3UFQ8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Carmil3Q3UFQ8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Carmil3Q3UFQ8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Carmil3Q3UFQ8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Carmil3Q3UFQ8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Carmil3Q3UFQ8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Carmil3Q3UFQ8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Carmil3Q3UFQ8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Carmil3Q3UFQ8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Carmil3Q3UFQ8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Carmil3Q3UFQ8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Carmil3Q3UFQ8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Carmil3Q3UFQ8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Carmil3Q3UFQ8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Carmil3Q3UFQ8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Carmil3Q3UFQ8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Carmil3Q3UFQ8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Carmil3Q3UFQ8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Carmil3Q3UFQ8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Carmil3Q3UFQ8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Carmil3Q3UFQ8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Carmil3Q3UFQ8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Carmil3Q3UFQ8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Carmil3Q3UFQ8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Carmil3Q3UFQ8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Carmil3Q3UFQ8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Carmil3Q3UFQ8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Carmil3Q3UFQ8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Carmil3Q3UFQ8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Carmil3Q3UFQ8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Carmil3Q3UFQ8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Carmil3Q3UFQ8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Carmil3Q3UFQ8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Carmil3Q3UFQ8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Carmil3Q3UFQ8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Carmil3Q3UFQ8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Carmil3Q3UFQ8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Carmil3Q3UFQ8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Carmil3Q3UFQ8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Carmil3Q3UFQ8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Carmil3Q3UFQ8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Carmil3Q3UFQ8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Carmil3Q3UFQ8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Carmil3Q3UFQ8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Carmil3Q3UFQ8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Carmil3Q3UFQ8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Carmil3Q3UFQ8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Carmil3Q3UFQ8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Carmil3Q3UFQ8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Carmil3Q3UFQ8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Carmil3Q3UFQ8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Carmil3Q3UFQ8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Carmil3Q3UFQ8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Carmil3Q3UFQ8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Carmil3Q3UFQ8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Carmil3Q3UFQ8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Carmil3Q3UFQ8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Carmil3Q3UFQ8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Carmil3Q3UFQ8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Carmil3Q3UFQ8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Carmil3Q3UFQ8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Carmil3Q3UFQ8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Carmil3Q3UFQ8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Carmil3Q3UFQ8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Carmil3Q3UFQ8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Carmil3Q3UFQ8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Carmil3Q3UFQ8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Carmil3Q3UFQ8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Carmil3Q3UFQ8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Carmil3Q3UFQ8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Carmil3Q3UFQ8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Carmil3Q3UFQ8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Carmil3Q3UFQ8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Carmil3Q3UFQ8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Carmil3Q3UFQ8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Carmil3Q3UFQ8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Carmil3Q3UFQ8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Carmil3Q3UFQ8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Carmil3Q3UFQ8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Carmil3Q3UFQ8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Carmil3Q3UFQ8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Carmil3Q3UFQ8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Carmil3Q3UFQ8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Carmil3Q3UFQ8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Carmil3Q3UFQ8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Carmil3Q3UFQ8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Carmil3Q3UFQ8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Carmil3Q3UFQ8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Carmil3Q3UFQ8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Carmil3Q3UFQ8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Carmil3Q3UFQ8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Carmil3Q3UFQ8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Carmil3Q3UFQ8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Carmil3Q3UFQ8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Carmil3Q3UFQ8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Carmil3Q3UFQ8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Carmil3Q3UFQ8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Carmil3Q3UFQ8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms