Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEN2

Fam35a, Protein FAM35A, mousemouse

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Length 891 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam35aQ3UEN2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fam35aQ3UEN2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam35aQ3UEN2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam35aQ3UEN2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam35aQ3UEN2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam35aQ3UEN2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam35aQ3UEN2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam35aQ3UEN2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam35aQ3UEN2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam35aQ3UEN2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam35aQ3UEN2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam35aQ3UEN2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam35aQ3UEN2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam35aQ3UEN2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam35aQ3UEN2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam35aQ3UEN2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam35aQ3UEN2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam35aQ3UEN2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam35aQ3UEN2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam35aQ3UEN2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam35aQ3UEN2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam35aQ3UEN2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam35aQ3UEN2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam35aQ3UEN2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam35aQ3UEN2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam35aQ3UEN2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam35aQ3UEN2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam35aQ3UEN2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam35aQ3UEN2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam35aQ3UEN2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam35aQ3UEN2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam35aQ3UEN2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam35aQ3UEN2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam35aQ3UEN2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam35aQ3UEN2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam35aQ3UEN2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam35aQ3UEN2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam35aQ3UEN2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam35aQ3UEN2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam35aQ3UEN2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam35aQ3UEN2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam35aQ3UEN2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam35aQ3UEN2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam35aQ3UEN2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam35aQ3UEN2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam35aQ3UEN2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fam35aQ3UEN2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fam35aQ3UEN2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Fam35aQ3UEN2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam35aQ3UEN2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam35aQ3UEN2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam35aQ3UEN2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam35aQ3UEN2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fam35aQ3UEN2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fam35aQ3UEN2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fam35aQ3UEN2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fam35aQ3UEN2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fam35aQ3UEN2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fam35aQ3UEN2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fam35aQ3UEN2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam35aQ3UEN2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam35aQ3UEN2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam35aQ3UEN2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam35aQ3UEN2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam35aQ3UEN2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam35aQ3UEN2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam35aQ3UEN2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam35aQ3UEN2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam35aQ3UEN2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam35aQ3UEN2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam35aQ3UEN2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam35aQ3UEN2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam35aQ3UEN2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fam35aQ3UEN2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Fam35aQ3UEN2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fam35aQ3UEN2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam35aQ3UEN2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam35aQ3UEN2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam35aQ3UEN2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam35aQ3UEN2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam35aQ3UEN2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam35aQ3UEN2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam35aQ3UEN2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam35aQ3UEN2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam35aQ3UEN2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam35aQ3UEN2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam35aQ3UEN2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam35aQ3UEN2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam35aQ3UEN2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam35aQ3UEN2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam35aQ3UEN2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam35aQ3UEN2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam35aQ3UEN2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam35aQ3UEN2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam35aQ3UEN2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam35aQ3UEN2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam35aQ3UEN2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam35aQ3UEN2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam35aQ3UEN2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam35aQ3UEN2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms