Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Puf60Q3UEB3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Puf60Q3UEB3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Puf60Q3UEB3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC31■■■□□ 2.55
Puf60Q3UEB3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Puf60Q3UEB3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Puf60Q3UEB3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Puf60Q3UEB3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Puf60Q3UEB3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Puf60Q3UEB3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Puf60Q3UEB3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
Puf60Q3UEB3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Puf60Q3UEB3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Puf60Q3UEB3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Puf60Q3UEB3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Puf60Q3UEB3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Puf60Q3UEB3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Puf60Q3UEB3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Puf60Q3UEB3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Puf60Q3UEB3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
Puf60Q3UEB3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Puf60Q3UEB3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Puf60Q3UEB3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Puf60Q3UEB3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
Puf60Q3UEB3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
Puf60Q3UEB3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Puf60Q3UEB3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Puf60Q3UEB3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
Puf60Q3UEB3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Puf60Q3UEB3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Puf60Q3UEB3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Puf60Q3UEB3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Puf60Q3UEB3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Puf60Q3UEB3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
Puf60Q3UEB3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Puf60Q3UEB3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Puf60Q3UEB3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Puf60Q3UEB3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
Puf60Q3UEB3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
Puf60Q3UEB3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Puf60Q3UEB3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Puf60Q3UEB3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Puf60Q3UEB3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Puf60Q3UEB3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Puf60Q3UEB3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Puf60Q3UEB3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Puf60Q3UEB3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Puf60Q3UEB3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Puf60Q3UEB3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Puf60Q3UEB3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
Puf60Q3UEB3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Puf60Q3UEB3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Puf60Q3UEB3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Puf60Q3UEB3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Puf60Q3UEB3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Puf60Q3UEB3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Puf60Q3UEB3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Puf60Q3UEB3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Puf60Q3UEB3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Puf60Q3UEB3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Puf60Q3UEB3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Puf60Q3UEB3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Puf60Q3UEB3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Puf60Q3UEB3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Puf60Q3UEB3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Puf60Q3UEB3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Puf60Q3UEB3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Puf60Q3UEB3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Puf60Q3UEB3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Puf60Q3UEB3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Puf60Q3UEB3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Puf60Q3UEB3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Puf60Q3UEB3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Puf60Q3UEB3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Puf60Q3UEB3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Puf60Q3UEB3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Puf60Q3UEB3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Puf60Q3UEB3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Puf60Q3UEB3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Puf60Q3UEB3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Puf60Q3UEB3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Puf60Q3UEB3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Puf60Q3UEB3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Puf60Q3UEB3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Puf60Q3UEB3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Puf60Q3UEB3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Puf60Q3UEB3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
Puf60Q3UEB3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Puf60Q3UEB3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Puf60Q3UEB3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Puf60Q3UEB3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Puf60Q3UEB3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Puf60Q3UEB3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Puf60Q3UEB3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Puf60Q3UEB3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Puf60Q3UEB3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Puf60Q3UEB3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Puf60Q3UEB3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Puf60Q3UEB3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Puf60Q3UEB3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms