Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trafd1Q3UDK1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trafd1Q3UDK1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trafd1Q3UDK1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trafd1Q3UDK1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trafd1Q3UDK1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trafd1Q3UDK1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Trafd1Q3UDK1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Trafd1Q3UDK1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trafd1Q3UDK1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trafd1Q3UDK1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trafd1Q3UDK1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trafd1Q3UDK1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trafd1Q3UDK1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trafd1Q3UDK1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trafd1Q3UDK1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trafd1Q3UDK1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trafd1Q3UDK1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trafd1Q3UDK1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trafd1Q3UDK1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trafd1Q3UDK1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trafd1Q3UDK1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trafd1Q3UDK1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trafd1Q3UDK1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trafd1Q3UDK1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trafd1Q3UDK1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trafd1Q3UDK1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trafd1Q3UDK1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trafd1Q3UDK1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trafd1Q3UDK1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trafd1Q3UDK1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Trafd1Q3UDK1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trafd1Q3UDK1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trafd1Q3UDK1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trafd1Q3UDK1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Trafd1Q3UDK1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trafd1Q3UDK1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trafd1Q3UDK1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trafd1Q3UDK1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trafd1Q3UDK1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trafd1Q3UDK1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trafd1Q3UDK1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trafd1Q3UDK1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trafd1Q3UDK1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trafd1Q3UDK1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trafd1Q3UDK1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trafd1Q3UDK1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trafd1Q3UDK1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trafd1Q3UDK1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trafd1Q3UDK1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trafd1Q3UDK1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trafd1Q3UDK1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trafd1Q3UDK1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trafd1Q3UDK1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trafd1Q3UDK1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trafd1Q3UDK1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Trafd1Q3UDK1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trafd1Q3UDK1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trafd1Q3UDK1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trafd1Q3UDK1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trafd1Q3UDK1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Trafd1Q3UDK1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trafd1Q3UDK1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trafd1Q3UDK1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trafd1Q3UDK1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trafd1Q3UDK1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trafd1Q3UDK1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trafd1Q3UDK1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trafd1Q3UDK1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trafd1Q3UDK1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trafd1Q3UDK1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trafd1Q3UDK1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trafd1Q3UDK1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trafd1Q3UDK1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trafd1Q3UDK1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Trafd1Q3UDK1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trafd1Q3UDK1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trafd1Q3UDK1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trafd1Q3UDK1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trafd1Q3UDK1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Trafd1Q3UDK1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trafd1Q3UDK1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trafd1Q3UDK1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Trafd1Q3UDK1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trafd1Q3UDK1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trafd1Q3UDK1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trafd1Q3UDK1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trafd1Q3UDK1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trafd1Q3UDK1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trafd1Q3UDK1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trafd1Q3UDK1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Trafd1Q3UDK1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trafd1Q3UDK1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trafd1Q3UDK1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trafd1Q3UDK1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trafd1Q3UDK1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trafd1Q3UDK1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trafd1Q3UDK1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trafd1Q3UDK1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trafd1Q3UDK1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms