Protein–RNA interactions for Protein: Q3U5C7

Prickle1, Prickle-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prickle1Q3U5C7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prickle1Q3U5C7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prickle1Q3U5C7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Prickle1Q3U5C7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prickle1Q3U5C7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prickle1Q3U5C7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prickle1Q3U5C7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Prickle1Q3U5C7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prickle1Q3U5C7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prickle1Q3U5C7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prickle1Q3U5C7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prickle1Q3U5C7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prickle1Q3U5C7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prickle1Q3U5C7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prickle1Q3U5C7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prickle1Q3U5C7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prickle1Q3U5C7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Prickle1Q3U5C7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prickle1Q3U5C7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prickle1Q3U5C7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prickle1Q3U5C7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prickle1Q3U5C7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prickle1Q3U5C7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prickle1Q3U5C7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Prickle1Q3U5C7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prickle1Q3U5C7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prickle1Q3U5C7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prickle1Q3U5C7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prickle1Q3U5C7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prickle1Q3U5C7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prickle1Q3U5C7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prickle1Q3U5C7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prickle1Q3U5C7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prickle1Q3U5C7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prickle1Q3U5C7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prickle1Q3U5C7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prickle1Q3U5C7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prickle1Q3U5C7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Prickle1Q3U5C7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prickle1Q3U5C7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prickle1Q3U5C7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prickle1Q3U5C7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prickle1Q3U5C7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prickle1Q3U5C7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prickle1Q3U5C7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prickle1Q3U5C7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prickle1Q3U5C7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Prickle1Q3U5C7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Prickle1Q3U5C7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prickle1Q3U5C7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prickle1Q3U5C7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prickle1Q3U5C7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prickle1Q3U5C7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prickle1Q3U5C7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prickle1Q3U5C7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prickle1Q3U5C7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prickle1Q3U5C7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Prickle1Q3U5C7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prickle1Q3U5C7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prickle1Q3U5C7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Prickle1Q3U5C7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prickle1Q3U5C7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prickle1Q3U5C7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prickle1Q3U5C7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prickle1Q3U5C7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prickle1Q3U5C7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prickle1Q3U5C7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prickle1Q3U5C7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prickle1Q3U5C7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prickle1Q3U5C7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prickle1Q3U5C7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prickle1Q3U5C7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prickle1Q3U5C7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prickle1Q3U5C7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prickle1Q3U5C7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prickle1Q3U5C7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prickle1Q3U5C7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prickle1Q3U5C7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prickle1Q3U5C7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prickle1Q3U5C7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prickle1Q3U5C7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prickle1Q3U5C7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prickle1Q3U5C7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prickle1Q3U5C7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prickle1Q3U5C7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Prickle1Q3U5C7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Prickle1Q3U5C7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Prickle1Q3U5C7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prickle1Q3U5C7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prickle1Q3U5C7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prickle1Q3U5C7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prickle1Q3U5C7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prickle1Q3U5C7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prickle1Q3U5C7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prickle1Q3U5C7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prickle1Q3U5C7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Prickle1Q3U5C7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prickle1Q3U5C7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prickle1Q3U5C7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Prickle1Q3U5C7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms