Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0S6

Rasip1, Ras-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasip1Q3U0S6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rasip1Q3U0S6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rasip1Q3U0S6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rasip1Q3U0S6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rasip1Q3U0S6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rasip1Q3U0S6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rasip1Q3U0S6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rasip1Q3U0S6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rasip1Q3U0S6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rasip1Q3U0S6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rasip1Q3U0S6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rasip1Q3U0S6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rasip1Q3U0S6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rasip1Q3U0S6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rasip1Q3U0S6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rasip1Q3U0S6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rasip1Q3U0S6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rasip1Q3U0S6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rasip1Q3U0S6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rasip1Q3U0S6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rasip1Q3U0S6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rasip1Q3U0S6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rasip1Q3U0S6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rasip1Q3U0S6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rasip1Q3U0S6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rasip1Q3U0S6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rasip1Q3U0S6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rasip1Q3U0S6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rasip1Q3U0S6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rasip1Q3U0S6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rasip1Q3U0S6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rasip1Q3U0S6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rasip1Q3U0S6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rasip1Q3U0S6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rasip1Q3U0S6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rasip1Q3U0S6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rasip1Q3U0S6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rasip1Q3U0S6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Rasip1Q3U0S6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rasip1Q3U0S6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rasip1Q3U0S6 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rasip1Q3U0S6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rasip1Q3U0S6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rasip1Q3U0S6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rasip1Q3U0S6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rasip1Q3U0S6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rasip1Q3U0S6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rasip1Q3U0S6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rasip1Q3U0S6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Rasip1Q3U0S6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Rasip1Q3U0S6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rasip1Q3U0S6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rasip1Q3U0S6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rasip1Q3U0S6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Rasip1Q3U0S6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rasip1Q3U0S6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Rasip1Q3U0S6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Rasip1Q3U0S6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rasip1Q3U0S6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rasip1Q3U0S6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rasip1Q3U0S6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rasip1Q3U0S6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rasip1Q3U0S6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rasip1Q3U0S6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rasip1Q3U0S6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rasip1Q3U0S6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rasip1Q3U0S6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rasip1Q3U0S6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rasip1Q3U0S6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rasip1Q3U0S6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rasip1Q3U0S6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rasip1Q3U0S6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Rasip1Q3U0S6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Rasip1Q3U0S6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rasip1Q3U0S6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rasip1Q3U0S6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rasip1Q3U0S6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rasip1Q3U0S6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rasip1Q3U0S6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rasip1Q3U0S6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rasip1Q3U0S6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rasip1Q3U0S6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rasip1Q3U0S6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rasip1Q3U0S6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rasip1Q3U0S6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rasip1Q3U0S6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rasip1Q3U0S6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rasip1Q3U0S6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rasip1Q3U0S6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rasip1Q3U0S6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rasip1Q3U0S6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rasip1Q3U0S6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rasip1Q3U0S6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Rasip1Q3U0S6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rasip1Q3U0S6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rasip1Q3U0S6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rasip1Q3U0S6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rasip1Q3U0S6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rasip1Q3U0S6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rasip1Q3U0S6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms