Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hace1Q3U0D9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hace1Q3U0D9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hace1Q3U0D9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hace1Q3U0D9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hace1Q3U0D9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hace1Q3U0D9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Hace1Q3U0D9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Hace1Q3U0D9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hace1Q3U0D9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hace1Q3U0D9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hace1Q3U0D9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hace1Q3U0D9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hace1Q3U0D9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hace1Q3U0D9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hace1Q3U0D9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hace1Q3U0D9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hace1Q3U0D9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hace1Q3U0D9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hace1Q3U0D9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hace1Q3U0D9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hace1Q3U0D9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hace1Q3U0D9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hace1Q3U0D9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hace1Q3U0D9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hace1Q3U0D9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hace1Q3U0D9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hace1Q3U0D9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hace1Q3U0D9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hace1Q3U0D9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hace1Q3U0D9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hace1Q3U0D9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hace1Q3U0D9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hace1Q3U0D9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hace1Q3U0D9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hace1Q3U0D9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Hace1Q3U0D9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hace1Q3U0D9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hace1Q3U0D9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hace1Q3U0D9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hace1Q3U0D9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hace1Q3U0D9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hace1Q3U0D9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hace1Q3U0D9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Hace1Q3U0D9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Hace1Q3U0D9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hace1Q3U0D9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hace1Q3U0D9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hace1Q3U0D9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hace1Q3U0D9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hace1Q3U0D9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hace1Q3U0D9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hace1Q3U0D9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hace1Q3U0D9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hace1Q3U0D9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hace1Q3U0D9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hace1Q3U0D9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hace1Q3U0D9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hace1Q3U0D9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hace1Q3U0D9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hace1Q3U0D9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hace1Q3U0D9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hace1Q3U0D9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hace1Q3U0D9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hace1Q3U0D9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Hace1Q3U0D9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hace1Q3U0D9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Hace1Q3U0D9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hace1Q3U0D9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hace1Q3U0D9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hace1Q3U0D9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hace1Q3U0D9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hace1Q3U0D9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hace1Q3U0D9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Hace1Q3U0D9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hace1Q3U0D9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hace1Q3U0D9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hace1Q3U0D9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hace1Q3U0D9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hace1Q3U0D9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hace1Q3U0D9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hace1Q3U0D9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hace1Q3U0D9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hace1Q3U0D9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hace1Q3U0D9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hace1Q3U0D9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hace1Q3U0D9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hace1Q3U0D9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hace1Q3U0D9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hace1Q3U0D9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Hace1Q3U0D9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hace1Q3U0D9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hace1Q3U0D9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hace1Q3U0D9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hace1Q3U0D9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hace1Q3U0D9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hace1Q3U0D9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hace1Q3U0D9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hace1Q3U0D9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hace1Q3U0D9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.1 ms