Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYV2

Hhla1, HERV-H LTR-associating protein 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hhla1Q3TYV2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hhla1Q3TYV2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hhla1Q3TYV2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hhla1Q3TYV2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hhla1Q3TYV2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hhla1Q3TYV2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hhla1Q3TYV2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hhla1Q3TYV2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hhla1Q3TYV2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hhla1Q3TYV2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hhla1Q3TYV2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hhla1Q3TYV2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hhla1Q3TYV2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hhla1Q3TYV2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hhla1Q3TYV2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hhla1Q3TYV2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hhla1Q3TYV2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hhla1Q3TYV2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hhla1Q3TYV2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hhla1Q3TYV2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hhla1Q3TYV2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hhla1Q3TYV2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hhla1Q3TYV2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hhla1Q3TYV2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hhla1Q3TYV2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hhla1Q3TYV2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hhla1Q3TYV2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hhla1Q3TYV2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hhla1Q3TYV2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hhla1Q3TYV2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Hhla1Q3TYV2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hhla1Q3TYV2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Hhla1Q3TYV2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hhla1Q3TYV2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hhla1Q3TYV2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hhla1Q3TYV2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hhla1Q3TYV2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hhla1Q3TYV2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hhla1Q3TYV2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hhla1Q3TYV2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hhla1Q3TYV2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hhla1Q3TYV2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hhla1Q3TYV2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hhla1Q3TYV2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hhla1Q3TYV2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hhla1Q3TYV2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hhla1Q3TYV2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hhla1Q3TYV2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hhla1Q3TYV2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hhla1Q3TYV2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hhla1Q3TYV2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hhla1Q3TYV2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hhla1Q3TYV2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hhla1Q3TYV2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hhla1Q3TYV2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hhla1Q3TYV2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hhla1Q3TYV2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hhla1Q3TYV2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hhla1Q3TYV2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hhla1Q3TYV2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hhla1Q3TYV2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hhla1Q3TYV2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hhla1Q3TYV2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Hhla1Q3TYV2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hhla1Q3TYV2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hhla1Q3TYV2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hhla1Q3TYV2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hhla1Q3TYV2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hhla1Q3TYV2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hhla1Q3TYV2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hhla1Q3TYV2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hhla1Q3TYV2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hhla1Q3TYV2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hhla1Q3TYV2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hhla1Q3TYV2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Hhla1Q3TYV2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hhla1Q3TYV2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hhla1Q3TYV2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Hhla1Q3TYV2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hhla1Q3TYV2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hhla1Q3TYV2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hhla1Q3TYV2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hhla1Q3TYV2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Hhla1Q3TYV2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Hhla1Q3TYV2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hhla1Q3TYV2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hhla1Q3TYV2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hhla1Q3TYV2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hhla1Q3TYV2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hhla1Q3TYV2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hhla1Q3TYV2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hhla1Q3TYV2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hhla1Q3TYV2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hhla1Q3TYV2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hhla1Q3TYV2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hhla1Q3TYV2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hhla1Q3TYV2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hhla1Q3TYV2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hhla1Q3TYV2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hhla1Q3TYV2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms