Protein–RNA interactions for Protein: Q3TX08

Trmt1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt1Q3TX08 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Trmt1Q3TX08 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Trmt1Q3TX08 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Trmt1Q3TX08 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trmt1Q3TX08 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trmt1Q3TX08 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trmt1Q3TX08 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trmt1Q3TX08 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trmt1Q3TX08 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trmt1Q3TX08 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trmt1Q3TX08 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trmt1Q3TX08 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trmt1Q3TX08 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trmt1Q3TX08 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trmt1Q3TX08 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trmt1Q3TX08 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trmt1Q3TX08 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trmt1Q3TX08 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Trmt1Q3TX08 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trmt1Q3TX08 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trmt1Q3TX08 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trmt1Q3TX08 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trmt1Q3TX08 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trmt1Q3TX08 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trmt1Q3TX08 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Trmt1Q3TX08 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trmt1Q3TX08 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trmt1Q3TX08 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trmt1Q3TX08 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Trmt1Q3TX08 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trmt1Q3TX08 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trmt1Q3TX08 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trmt1Q3TX08 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trmt1Q3TX08 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trmt1Q3TX08 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trmt1Q3TX08 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trmt1Q3TX08 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Trmt1Q3TX08 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trmt1Q3TX08 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trmt1Q3TX08 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trmt1Q3TX08 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trmt1Q3TX08 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trmt1Q3TX08 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trmt1Q3TX08 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trmt1Q3TX08 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trmt1Q3TX08 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trmt1Q3TX08 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trmt1Q3TX08 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trmt1Q3TX08 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Trmt1Q3TX08 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trmt1Q3TX08 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trmt1Q3TX08 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Trmt1Q3TX08 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trmt1Q3TX08 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trmt1Q3TX08 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trmt1Q3TX08 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trmt1Q3TX08 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trmt1Q3TX08 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trmt1Q3TX08 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trmt1Q3TX08 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trmt1Q3TX08 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trmt1Q3TX08 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trmt1Q3TX08 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trmt1Q3TX08 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trmt1Q3TX08 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trmt1Q3TX08 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trmt1Q3TX08 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Trmt1Q3TX08 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trmt1Q3TX08 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trmt1Q3TX08 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trmt1Q3TX08 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trmt1Q3TX08 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trmt1Q3TX08 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trmt1Q3TX08 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trmt1Q3TX08 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trmt1Q3TX08 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trmt1Q3TX08 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trmt1Q3TX08 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trmt1Q3TX08 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trmt1Q3TX08 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trmt1Q3TX08 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trmt1Q3TX08 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trmt1Q3TX08 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trmt1Q3TX08 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trmt1Q3TX08 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trmt1Q3TX08 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trmt1Q3TX08 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trmt1Q3TX08 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trmt1Q3TX08 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trmt1Q3TX08 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trmt1Q3TX08 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trmt1Q3TX08 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trmt1Q3TX08 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trmt1Q3TX08 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trmt1Q3TX08 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trmt1Q3TX08 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trmt1Q3TX08 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trmt1Q3TX08 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Trmt1Q3TX08 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Trmt1Q3TX08 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms