Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVW5

Tchp, Trichoplein keratin filament-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TchpQ3TVW5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TchpQ3TVW5 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TchpQ3TVW5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TchpQ3TVW5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TchpQ3TVW5 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TchpQ3TVW5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TchpQ3TVW5 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TchpQ3TVW5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TchpQ3TVW5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TchpQ3TVW5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TchpQ3TVW5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TchpQ3TVW5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TchpQ3TVW5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TchpQ3TVW5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TchpQ3TVW5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TchpQ3TVW5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TchpQ3TVW5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TchpQ3TVW5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TchpQ3TVW5 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TchpQ3TVW5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TchpQ3TVW5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TchpQ3TVW5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TchpQ3TVW5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TchpQ3TVW5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TchpQ3TVW5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TchpQ3TVW5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TchpQ3TVW5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TchpQ3TVW5 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TchpQ3TVW5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TchpQ3TVW5 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TchpQ3TVW5 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TchpQ3TVW5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TchpQ3TVW5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TchpQ3TVW5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TchpQ3TVW5 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TchpQ3TVW5 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TchpQ3TVW5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TchpQ3TVW5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TchpQ3TVW5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TchpQ3TVW5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TchpQ3TVW5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TchpQ3TVW5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TchpQ3TVW5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TchpQ3TVW5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TchpQ3TVW5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TchpQ3TVW5 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TchpQ3TVW5 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TchpQ3TVW5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TchpQ3TVW5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TchpQ3TVW5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TchpQ3TVW5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TchpQ3TVW5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TchpQ3TVW5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TchpQ3TVW5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TchpQ3TVW5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TchpQ3TVW5 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TchpQ3TVW5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TchpQ3TVW5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TchpQ3TVW5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TchpQ3TVW5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TchpQ3TVW5 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TchpQ3TVW5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TchpQ3TVW5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TchpQ3TVW5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TchpQ3TVW5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TchpQ3TVW5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TchpQ3TVW5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TchpQ3TVW5 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TchpQ3TVW5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TchpQ3TVW5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TchpQ3TVW5 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TchpQ3TVW5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TchpQ3TVW5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TchpQ3TVW5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TchpQ3TVW5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TchpQ3TVW5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TchpQ3TVW5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TchpQ3TVW5 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TchpQ3TVW5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TchpQ3TVW5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TchpQ3TVW5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TchpQ3TVW5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TchpQ3TVW5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TchpQ3TVW5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TchpQ3TVW5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TchpQ3TVW5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TchpQ3TVW5 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TchpQ3TVW5 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TchpQ3TVW5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TchpQ3TVW5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TchpQ3TVW5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TchpQ3TVW5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TchpQ3TVW5 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TchpQ3TVW5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TchpQ3TVW5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TchpQ3TVW5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TchpQ3TVW5 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TchpQ3TVW5 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TchpQ3TVW5 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TchpQ3TVW5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms