Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQQ9

Uncharacterized protein C1orf112 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 903 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TQQ9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Q3TQQ9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Q3TQQ9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Q3TQQ9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Q3TQQ9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q3TQQ9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q3TQQ9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Q3TQQ9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q3TQQ9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q3TQQ9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q3TQQ9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q3TQQ9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Q3TQQ9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Q3TQQ9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Q3TQQ9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q3TQQ9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q3TQQ9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q3TQQ9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q3TQQ9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q3TQQ9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q3TQQ9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Q3TQQ9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Q3TQQ9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Q3TQQ9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Q3TQQ9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Q3TQQ9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q3TQQ9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q3TQQ9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q3TQQ9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q3TQQ9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q3TQQ9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q3TQQ9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q3TQQ9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q3TQQ9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q3TQQ9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q3TQQ9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q3TQQ9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q3TQQ9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q3TQQ9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q3TQQ9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q3TQQ9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q3TQQ9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q3TQQ9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q3TQQ9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q3TQQ9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q3TQQ9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q3TQQ9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q3TQQ9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Q3TQQ9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Q3TQQ9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Q3TQQ9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q3TQQ9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q3TQQ9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q3TQQ9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q3TQQ9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q3TQQ9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q3TQQ9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q3TQQ9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q3TQQ9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Q3TQQ9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q3TQQ9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q3TQQ9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q3TQQ9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q3TQQ9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q3TQQ9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q3TQQ9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q3TQQ9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q3TQQ9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q3TQQ9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q3TQQ9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q3TQQ9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q3TQQ9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q3TQQ9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q3TQQ9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q3TQQ9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q3TQQ9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Q3TQQ9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Q3TQQ9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Q3TQQ9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Q3TQQ9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Q3TQQ9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Q3TQQ9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Q3TQQ9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q3TQQ9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q3TQQ9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q3TQQ9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q3TQQ9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q3TQQ9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q3TQQ9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q3TQQ9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q3TQQ9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q3TQQ9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q3TQQ9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q3TQQ9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q3TQQ9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Q3TQQ9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Q3TQQ9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q3TQQ9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q3TQQ9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q3TQQ9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms