Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQ03

Ciart, Circadian-associated transcriptional repressor, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CiartQ3TQ03 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CiartQ3TQ03 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CiartQ3TQ03 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CiartQ3TQ03 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CiartQ3TQ03 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CiartQ3TQ03 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CiartQ3TQ03 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CiartQ3TQ03 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CiartQ3TQ03 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CiartQ3TQ03 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CiartQ3TQ03 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CiartQ3TQ03 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CiartQ3TQ03 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CiartQ3TQ03 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CiartQ3TQ03 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CiartQ3TQ03 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CiartQ3TQ03 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CiartQ3TQ03 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CiartQ3TQ03 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CiartQ3TQ03 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CiartQ3TQ03 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CiartQ3TQ03 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CiartQ3TQ03 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CiartQ3TQ03 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CiartQ3TQ03 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CiartQ3TQ03 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CiartQ3TQ03 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CiartQ3TQ03 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CiartQ3TQ03 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CiartQ3TQ03 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CiartQ3TQ03 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CiartQ3TQ03 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CiartQ3TQ03 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CiartQ3TQ03 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CiartQ3TQ03 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CiartQ3TQ03 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CiartQ3TQ03 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CiartQ3TQ03 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CiartQ3TQ03 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CiartQ3TQ03 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CiartQ3TQ03 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CiartQ3TQ03 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CiartQ3TQ03 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CiartQ3TQ03 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CiartQ3TQ03 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CiartQ3TQ03 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CiartQ3TQ03 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CiartQ3TQ03 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CiartQ3TQ03 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CiartQ3TQ03 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
CiartQ3TQ03 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CiartQ3TQ03 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CiartQ3TQ03 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CiartQ3TQ03 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CiartQ3TQ03 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CiartQ3TQ03 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CiartQ3TQ03 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CiartQ3TQ03 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CiartQ3TQ03 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CiartQ3TQ03 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CiartQ3TQ03 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CiartQ3TQ03 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CiartQ3TQ03 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CiartQ3TQ03 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CiartQ3TQ03 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CiartQ3TQ03 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CiartQ3TQ03 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CiartQ3TQ03 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CiartQ3TQ03 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CiartQ3TQ03 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CiartQ3TQ03 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CiartQ3TQ03 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CiartQ3TQ03 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CiartQ3TQ03 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CiartQ3TQ03 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CiartQ3TQ03 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CiartQ3TQ03 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CiartQ3TQ03 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CiartQ3TQ03 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CiartQ3TQ03 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CiartQ3TQ03 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CiartQ3TQ03 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CiartQ3TQ03 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CiartQ3TQ03 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CiartQ3TQ03 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CiartQ3TQ03 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CiartQ3TQ03 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CiartQ3TQ03 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CiartQ3TQ03 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CiartQ3TQ03 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CiartQ3TQ03 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CiartQ3TQ03 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CiartQ3TQ03 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CiartQ3TQ03 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CiartQ3TQ03 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CiartQ3TQ03 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CiartQ3TQ03 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CiartQ3TQ03 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CiartQ3TQ03 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CiartQ3TQ03 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms