Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc102aQ3TMW1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc102aQ3TMW1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc102aQ3TMW1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc102aQ3TMW1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc102aQ3TMW1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc102aQ3TMW1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc102aQ3TMW1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc102aQ3TMW1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc102aQ3TMW1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ccdc102aQ3TMW1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc102aQ3TMW1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc102aQ3TMW1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc102aQ3TMW1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc102aQ3TMW1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc102aQ3TMW1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc102aQ3TMW1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc102aQ3TMW1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc102aQ3TMW1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc102aQ3TMW1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc102aQ3TMW1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc102aQ3TMW1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc102aQ3TMW1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc102aQ3TMW1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc102aQ3TMW1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc102aQ3TMW1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc102aQ3TMW1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc102aQ3TMW1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc102aQ3TMW1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc102aQ3TMW1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc102aQ3TMW1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc102aQ3TMW1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc102aQ3TMW1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc102aQ3TMW1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc102aQ3TMW1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc102aQ3TMW1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc102aQ3TMW1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc102aQ3TMW1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccdc102aQ3TMW1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc102aQ3TMW1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ccdc102aQ3TMW1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc102aQ3TMW1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc102aQ3TMW1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc102aQ3TMW1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc102aQ3TMW1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc102aQ3TMW1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc102aQ3TMW1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc102aQ3TMW1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc102aQ3TMW1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccdc102aQ3TMW1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc102aQ3TMW1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc102aQ3TMW1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc102aQ3TMW1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc102aQ3TMW1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc102aQ3TMW1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc102aQ3TMW1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc102aQ3TMW1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc102aQ3TMW1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc102aQ3TMW1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc102aQ3TMW1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc102aQ3TMW1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc102aQ3TMW1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc102aQ3TMW1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc102aQ3TMW1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc102aQ3TMW1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc102aQ3TMW1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc102aQ3TMW1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc102aQ3TMW1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc102aQ3TMW1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc102aQ3TMW1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc102aQ3TMW1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc102aQ3TMW1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc102aQ3TMW1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc102aQ3TMW1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc102aQ3TMW1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc102aQ3TMW1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc102aQ3TMW1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc102aQ3TMW1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc102aQ3TMW1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc102aQ3TMW1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc102aQ3TMW1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc102aQ3TMW1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc102aQ3TMW1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc102aQ3TMW1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc102aQ3TMW1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc102aQ3TMW1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc102aQ3TMW1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc102aQ3TMW1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc102aQ3TMW1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc102aQ3TMW1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc102aQ3TMW1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc102aQ3TMW1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc102aQ3TMW1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc102aQ3TMW1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc102aQ3TMW1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms