Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gtf3c3Q3TMP1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Gtf3c3Q3TMP1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gtf3c3Q3TMP1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gtf3c3Q3TMP1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Gtf3c3Q3TMP1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gtf3c3Q3TMP1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gtf3c3Q3TMP1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gtf3c3Q3TMP1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gtf3c3Q3TMP1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gtf3c3Q3TMP1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gtf3c3Q3TMP1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gtf3c3Q3TMP1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Gtf3c3Q3TMP1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gtf3c3Q3TMP1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gtf3c3Q3TMP1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gtf3c3Q3TMP1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Gtf3c3Q3TMP1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gtf3c3Q3TMP1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gtf3c3Q3TMP1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gtf3c3Q3TMP1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Gtf3c3Q3TMP1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gtf3c3Q3TMP1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Gtf3c3Q3TMP1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gtf3c3Q3TMP1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gtf3c3Q3TMP1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Gtf3c3Q3TMP1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gtf3c3Q3TMP1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Gtf3c3Q3TMP1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Gtf3c3Q3TMP1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gtf3c3Q3TMP1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gtf3c3Q3TMP1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Gtf3c3Q3TMP1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Gtf3c3Q3TMP1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gtf3c3Q3TMP1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gtf3c3Q3TMP1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gtf3c3Q3TMP1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gtf3c3Q3TMP1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Gtf3c3Q3TMP1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gtf3c3Q3TMP1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gtf3c3Q3TMP1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gtf3c3Q3TMP1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gtf3c3Q3TMP1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Gtf3c3Q3TMP1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gtf3c3Q3TMP1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gtf3c3Q3TMP1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gtf3c3Q3TMP1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Gtf3c3Q3TMP1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gtf3c3Q3TMP1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gtf3c3Q3TMP1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gtf3c3Q3TMP1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gtf3c3Q3TMP1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gtf3c3Q3TMP1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Gtf3c3Q3TMP1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Gtf3c3Q3TMP1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gtf3c3Q3TMP1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gtf3c3Q3TMP1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Gtf3c3Q3TMP1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gtf3c3Q3TMP1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gtf3c3Q3TMP1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Gtf3c3Q3TMP1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Gtf3c3Q3TMP1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
Gtf3c3Q3TMP1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gtf3c3Q3TMP1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gtf3c3Q3TMP1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gtf3c3Q3TMP1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gtf3c3Q3TMP1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Gtf3c3Q3TMP1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gtf3c3Q3TMP1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gtf3c3Q3TMP1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gtf3c3Q3TMP1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gtf3c3Q3TMP1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gtf3c3Q3TMP1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gtf3c3Q3TMP1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gtf3c3Q3TMP1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Gtf3c3Q3TMP1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Gtf3c3Q3TMP1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gtf3c3Q3TMP1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gtf3c3Q3TMP1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Gtf3c3Q3TMP1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gtf3c3Q3TMP1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gtf3c3Q3TMP1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gtf3c3Q3TMP1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gtf3c3Q3TMP1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gtf3c3Q3TMP1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gtf3c3Q3TMP1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gtf3c3Q3TMP1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gtf3c3Q3TMP1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gtf3c3Q3TMP1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gtf3c3Q3TMP1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gtf3c3Q3TMP1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gtf3c3Q3TMP1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gtf3c3Q3TMP1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Gtf3c3Q3TMP1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gtf3c3Q3TMP1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gtf3c3Q3TMP1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gtf3c3Q3TMP1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms