Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Usp39Q3TIX9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp39Q3TIX9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp39Q3TIX9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp39Q3TIX9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp39Q3TIX9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Usp39Q3TIX9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp39Q3TIX9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp39Q3TIX9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp39Q3TIX9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp39Q3TIX9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp39Q3TIX9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp39Q3TIX9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp39Q3TIX9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp39Q3TIX9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp39Q3TIX9 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp39Q3TIX9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp39Q3TIX9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp39Q3TIX9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp39Q3TIX9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp39Q3TIX9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp39Q3TIX9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp39Q3TIX9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp39Q3TIX9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp39Q3TIX9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp39Q3TIX9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp39Q3TIX9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp39Q3TIX9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp39Q3TIX9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp39Q3TIX9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp39Q3TIX9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp39Q3TIX9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp39Q3TIX9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp39Q3TIX9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp39Q3TIX9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp39Q3TIX9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp39Q3TIX9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp39Q3TIX9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp39Q3TIX9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp39Q3TIX9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp39Q3TIX9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp39Q3TIX9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp39Q3TIX9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp39Q3TIX9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp39Q3TIX9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp39Q3TIX9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp39Q3TIX9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp39Q3TIX9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp39Q3TIX9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp39Q3TIX9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp39Q3TIX9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp39Q3TIX9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp39Q3TIX9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp39Q3TIX9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp39Q3TIX9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp39Q3TIX9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp39Q3TIX9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp39Q3TIX9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp39Q3TIX9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp39Q3TIX9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp39Q3TIX9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp39Q3TIX9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp39Q3TIX9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp39Q3TIX9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp39Q3TIX9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp39Q3TIX9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp39Q3TIX9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp39Q3TIX9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp39Q3TIX9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp39Q3TIX9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp39Q3TIX9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp39Q3TIX9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp39Q3TIX9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp39Q3TIX9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp39Q3TIX9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp39Q3TIX9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp39Q3TIX9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp39Q3TIX9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp39Q3TIX9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp39Q3TIX9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp39Q3TIX9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp39Q3TIX9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp39Q3TIX9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp39Q3TIX9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp39Q3TIX9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp39Q3TIX9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp39Q3TIX9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp39Q3TIX9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp39Q3TIX9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp39Q3TIX9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp39Q3TIX9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp39Q3TIX9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp39Q3TIX9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp39Q3TIX9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp39Q3TIX9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp39Q3TIX9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp39Q3TIX9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp39Q3TIX9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp39Q3TIX9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp39Q3TIX9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms