Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNP5

V1rd19, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V1rd19Q3KNP5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
V1rd19Q3KNP5 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
V1rd19Q3KNP5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
V1rd19Q3KNP5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
V1rd19Q3KNP5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
V1rd19Q3KNP5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
V1rd19Q3KNP5 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
V1rd19Q3KNP5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
V1rd19Q3KNP5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
V1rd19Q3KNP5 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
V1rd19Q3KNP5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
V1rd19Q3KNP5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
V1rd19Q3KNP5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
V1rd19Q3KNP5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
V1rd19Q3KNP5 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
V1rd19Q3KNP5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
V1rd19Q3KNP5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
V1rd19Q3KNP5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
V1rd19Q3KNP5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
V1rd19Q3KNP5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
V1rd19Q3KNP5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
V1rd19Q3KNP5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
V1rd19Q3KNP5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
V1rd19Q3KNP5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
V1rd19Q3KNP5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
V1rd19Q3KNP5 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
V1rd19Q3KNP5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
V1rd19Q3KNP5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
V1rd19Q3KNP5 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
V1rd19Q3KNP5 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
V1rd19Q3KNP5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
V1rd19Q3KNP5 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
V1rd19Q3KNP5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
V1rd19Q3KNP5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
V1rd19Q3KNP5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
V1rd19Q3KNP5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
V1rd19Q3KNP5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
V1rd19Q3KNP5 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
V1rd19Q3KNP5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
V1rd19Q3KNP5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
V1rd19Q3KNP5 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
V1rd19Q3KNP5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
V1rd19Q3KNP5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
V1rd19Q3KNP5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
V1rd19Q3KNP5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
V1rd19Q3KNP5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
V1rd19Q3KNP5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
V1rd19Q3KNP5 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
V1rd19Q3KNP5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
V1rd19Q3KNP5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
V1rd19Q3KNP5 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
V1rd19Q3KNP5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
V1rd19Q3KNP5 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
V1rd19Q3KNP5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
V1rd19Q3KNP5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
V1rd19Q3KNP5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
V1rd19Q3KNP5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
V1rd19Q3KNP5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
V1rd19Q3KNP5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
V1rd19Q3KNP5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
V1rd19Q3KNP5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
V1rd19Q3KNP5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
V1rd19Q3KNP5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
V1rd19Q3KNP5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
V1rd19Q3KNP5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
V1rd19Q3KNP5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
V1rd19Q3KNP5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
V1rd19Q3KNP5 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
V1rd19Q3KNP5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
V1rd19Q3KNP5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
V1rd19Q3KNP5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
V1rd19Q3KNP5 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
V1rd19Q3KNP5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
V1rd19Q3KNP5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
V1rd19Q3KNP5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
V1rd19Q3KNP5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
V1rd19Q3KNP5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
V1rd19Q3KNP5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
V1rd19Q3KNP5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
V1rd19Q3KNP5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
V1rd19Q3KNP5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
V1rd19Q3KNP5 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
V1rd19Q3KNP5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
V1rd19Q3KNP5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
V1rd19Q3KNP5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
V1rd19Q3KNP5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
V1rd19Q3KNP5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
V1rd19Q3KNP5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
V1rd19Q3KNP5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
V1rd19Q3KNP5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
V1rd19Q3KNP5 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
V1rd19Q3KNP5 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
V1rd19Q3KNP5 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
V1rd19Q3KNP5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
V1rd19Q3KNP5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
V1rd19Q3KNP5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
V1rd19Q3KNP5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
V1rd19Q3KNP5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
V1rd19Q3KNP5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
V1rd19Q3KNP5 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.5 ms