Protein–RNA interactions for Protein: Q30D77

Col24a1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col24a1Q30D77 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Col24a1Q30D77 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Col24a1Q30D77 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Col24a1Q30D77 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Col24a1Q30D77 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Col24a1Q30D77 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Col24a1Q30D77 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Col24a1Q30D77 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Col24a1Q30D77 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Col24a1Q30D77 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Col24a1Q30D77 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Col24a1Q30D77 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Col24a1Q30D77 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Col24a1Q30D77 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Col24a1Q30D77 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Col24a1Q30D77 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Col24a1Q30D77 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Col24a1Q30D77 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Col24a1Q30D77 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Col24a1Q30D77 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Col24a1Q30D77 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Col24a1Q30D77 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Col24a1Q30D77 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Col24a1Q30D77 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Col24a1Q30D77 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Col24a1Q30D77 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Col24a1Q30D77 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Col24a1Q30D77 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Col24a1Q30D77 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Col24a1Q30D77 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Col24a1Q30D77 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Col24a1Q30D77 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Col24a1Q30D77 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Col24a1Q30D77 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Col24a1Q30D77 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Col24a1Q30D77 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Col24a1Q30D77 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Col24a1Q30D77 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Col24a1Q30D77 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Col24a1Q30D77 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Col24a1Q30D77 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Col24a1Q30D77 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Col24a1Q30D77 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Col24a1Q30D77 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Col24a1Q30D77 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Col24a1Q30D77 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Col24a1Q30D77 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Col24a1Q30D77 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Col24a1Q30D77 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Col24a1Q30D77 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Col24a1Q30D77 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Col24a1Q30D77 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Col24a1Q30D77 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Col24a1Q30D77 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Col24a1Q30D77 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Col24a1Q30D77 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Col24a1Q30D77 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Col24a1Q30D77 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Col24a1Q30D77 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Col24a1Q30D77 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Col24a1Q30D77 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Col24a1Q30D77 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Col24a1Q30D77 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Col24a1Q30D77 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Col24a1Q30D77 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Col24a1Q30D77 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Col24a1Q30D77 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Col24a1Q30D77 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Col24a1Q30D77 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Col24a1Q30D77 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Col24a1Q30D77 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Col24a1Q30D77 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Col24a1Q30D77 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Col24a1Q30D77 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
Col24a1Q30D77 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Col24a1Q30D77 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Col24a1Q30D77 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Col24a1Q30D77 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Col24a1Q30D77 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Col24a1Q30D77 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Col24a1Q30D77 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Col24a1Q30D77 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Col24a1Q30D77 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Col24a1Q30D77 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Col24a1Q30D77 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Col24a1Q30D77 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Col24a1Q30D77 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Col24a1Q30D77 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Col24a1Q30D77 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Col24a1Q30D77 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Col24a1Q30D77 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Col24a1Q30D77 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Col24a1Q30D77 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Col24a1Q30D77 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Col24a1Q30D77 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Col24a1Q30D77 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Col24a1Q30D77 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Col24a1Q30D77 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Col24a1Q30D77 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Col24a1Q30D77 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms