Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPR5

Hdgfl1, Hepatoma-derived growth factor-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl1Q2VPR5 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hdgfl1Q2VPR5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Hdgfl1Q2VPR5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hdgfl1Q2VPR5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hdgfl1Q2VPR5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hdgfl1Q2VPR5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hdgfl1Q2VPR5 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hdgfl1Q2VPR5 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hdgfl1Q2VPR5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hdgfl1Q2VPR5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Hdgfl1Q2VPR5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Hdgfl1Q2VPR5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hdgfl1Q2VPR5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hdgfl1Q2VPR5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hdgfl1Q2VPR5 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hdgfl1Q2VPR5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hdgfl1Q2VPR5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hdgfl1Q2VPR5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hdgfl1Q2VPR5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hdgfl1Q2VPR5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hdgfl1Q2VPR5 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hdgfl1Q2VPR5 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hdgfl1Q2VPR5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hdgfl1Q2VPR5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hdgfl1Q2VPR5 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hdgfl1Q2VPR5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hdgfl1Q2VPR5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Hdgfl1Q2VPR5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hdgfl1Q2VPR5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hdgfl1Q2VPR5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Hdgfl1Q2VPR5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hdgfl1Q2VPR5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hdgfl1Q2VPR5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hdgfl1Q2VPR5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hdgfl1Q2VPR5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hdgfl1Q2VPR5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hdgfl1Q2VPR5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hdgfl1Q2VPR5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hdgfl1Q2VPR5 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hdgfl1Q2VPR5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hdgfl1Q2VPR5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hdgfl1Q2VPR5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hdgfl1Q2VPR5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hdgfl1Q2VPR5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hdgfl1Q2VPR5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hdgfl1Q2VPR5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hdgfl1Q2VPR5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Hdgfl1Q2VPR5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hdgfl1Q2VPR5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hdgfl1Q2VPR5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hdgfl1Q2VPR5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hdgfl1Q2VPR5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hdgfl1Q2VPR5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hdgfl1Q2VPR5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hdgfl1Q2VPR5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hdgfl1Q2VPR5 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hdgfl1Q2VPR5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hdgfl1Q2VPR5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hdgfl1Q2VPR5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hdgfl1Q2VPR5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hdgfl1Q2VPR5 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hdgfl1Q2VPR5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Hdgfl1Q2VPR5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hdgfl1Q2VPR5 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hdgfl1Q2VPR5 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hdgfl1Q2VPR5 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hdgfl1Q2VPR5 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hdgfl1Q2VPR5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hdgfl1Q2VPR5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hdgfl1Q2VPR5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Hdgfl1Q2VPR5 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hdgfl1Q2VPR5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hdgfl1Q2VPR5 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hdgfl1Q2VPR5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hdgfl1Q2VPR5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hdgfl1Q2VPR5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hdgfl1Q2VPR5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hdgfl1Q2VPR5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hdgfl1Q2VPR5 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hdgfl1Q2VPR5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hdgfl1Q2VPR5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hdgfl1Q2VPR5 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hdgfl1Q2VPR5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hdgfl1Q2VPR5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hdgfl1Q2VPR5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Hdgfl1Q2VPR5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Hdgfl1Q2VPR5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Hdgfl1Q2VPR5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Hdgfl1Q2VPR5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hdgfl1Q2VPR5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hdgfl1Q2VPR5 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hdgfl1Q2VPR5 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hdgfl1Q2VPR5 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hdgfl1Q2VPR5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hdgfl1Q2VPR5 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hdgfl1Q2VPR5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hdgfl1Q2VPR5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hdgfl1Q2VPR5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hdgfl1Q2VPR5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hdgfl1Q2VPR5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms