Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Cers3Q1A3B0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cers3Q1A3B0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cers3Q1A3B0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cers3Q1A3B0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cers3Q1A3B0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cers3Q1A3B0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cers3Q1A3B0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cers3Q1A3B0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cers3Q1A3B0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cers3Q1A3B0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cers3Q1A3B0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cers3Q1A3B0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cers3Q1A3B0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cers3Q1A3B0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cers3Q1A3B0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Cers3Q1A3B0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cers3Q1A3B0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cers3Q1A3B0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Cers3Q1A3B0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cers3Q1A3B0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cers3Q1A3B0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cers3Q1A3B0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cers3Q1A3B0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cers3Q1A3B0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cers3Q1A3B0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cers3Q1A3B0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cers3Q1A3B0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cers3Q1A3B0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cers3Q1A3B0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cers3Q1A3B0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Cers3Q1A3B0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cers3Q1A3B0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cers3Q1A3B0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cers3Q1A3B0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Cers3Q1A3B0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cers3Q1A3B0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cers3Q1A3B0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cers3Q1A3B0 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cers3Q1A3B0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cers3Q1A3B0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cers3Q1A3B0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cers3Q1A3B0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cers3Q1A3B0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cers3Q1A3B0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cers3Q1A3B0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cers3Q1A3B0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cers3Q1A3B0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cers3Q1A3B0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cers3Q1A3B0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Cers3Q1A3B0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Cers3Q1A3B0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cers3Q1A3B0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cers3Q1A3B0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cers3Q1A3B0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Cers3Q1A3B0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cers3Q1A3B0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cers3Q1A3B0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cers3Q1A3B0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cers3Q1A3B0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cers3Q1A3B0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cers3Q1A3B0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cers3Q1A3B0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cers3Q1A3B0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cers3Q1A3B0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cers3Q1A3B0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cers3Q1A3B0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cers3Q1A3B0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cers3Q1A3B0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cers3Q1A3B0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cers3Q1A3B0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cers3Q1A3B0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cers3Q1A3B0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cers3Q1A3B0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cers3Q1A3B0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cers3Q1A3B0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cers3Q1A3B0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cers3Q1A3B0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cers3Q1A3B0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cers3Q1A3B0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Cers3Q1A3B0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Cers3Q1A3B0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cers3Q1A3B0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cers3Q1A3B0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cers3Q1A3B0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cers3Q1A3B0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cers3Q1A3B0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cers3Q1A3B0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Cers3Q1A3B0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cers3Q1A3B0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cers3Q1A3B0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cers3Q1A3B0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cers3Q1A3B0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cers3Q1A3B0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cers3Q1A3B0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Cers3Q1A3B0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cers3Q1A3B0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cers3Q1A3B0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cers3Q1A3B0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cers3Q1A3B0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.7 ms