Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBK2

Krt80, Keratin, type II cytoskeletal 80, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt80Q0VBK2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Krt80Q0VBK2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Krt80Q0VBK2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Krt80Q0VBK2 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Krt80Q0VBK2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Krt80Q0VBK2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Krt80Q0VBK2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Krt80Q0VBK2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Krt80Q0VBK2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Krt80Q0VBK2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Krt80Q0VBK2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Krt80Q0VBK2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Krt80Q0VBK2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Krt80Q0VBK2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Krt80Q0VBK2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt80Q0VBK2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt80Q0VBK2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt80Q0VBK2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt80Q0VBK2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt80Q0VBK2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt80Q0VBK2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt80Q0VBK2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt80Q0VBK2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krt80Q0VBK2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krt80Q0VBK2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krt80Q0VBK2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krt80Q0VBK2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krt80Q0VBK2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krt80Q0VBK2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krt80Q0VBK2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krt80Q0VBK2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt80Q0VBK2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt80Q0VBK2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt80Q0VBK2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt80Q0VBK2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt80Q0VBK2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt80Q0VBK2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krt80Q0VBK2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Krt80Q0VBK2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt80Q0VBK2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt80Q0VBK2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt80Q0VBK2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt80Q0VBK2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Krt80Q0VBK2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Krt80Q0VBK2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Krt80Q0VBK2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Krt80Q0VBK2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Krt80Q0VBK2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Krt80Q0VBK2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Krt80Q0VBK2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt80Q0VBK2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt80Q0VBK2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt80Q0VBK2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt80Q0VBK2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Krt80Q0VBK2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Krt80Q0VBK2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Krt80Q0VBK2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Krt80Q0VBK2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt80Q0VBK2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt80Q0VBK2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt80Q0VBK2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt80Q0VBK2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt80Q0VBK2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt80Q0VBK2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt80Q0VBK2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt80Q0VBK2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt80Q0VBK2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt80Q0VBK2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt80Q0VBK2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt80Q0VBK2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt80Q0VBK2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt80Q0VBK2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt80Q0VBK2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt80Q0VBK2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt80Q0VBK2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Krt80Q0VBK2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt80Q0VBK2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt80Q0VBK2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt80Q0VBK2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt80Q0VBK2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt80Q0VBK2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt80Q0VBK2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Krt80Q0VBK2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt80Q0VBK2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt80Q0VBK2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt80Q0VBK2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt80Q0VBK2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt80Q0VBK2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt80Q0VBK2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Krt80Q0VBK2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Krt80Q0VBK2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Krt80Q0VBK2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Krt80Q0VBK2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Krt80Q0VBK2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Krt80Q0VBK2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Krt80Q0VBK2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Krt80Q0VBK2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt80Q0VBK2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt80Q0VBK2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt80Q0VBK2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms