Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Ttc21bQ0HA38 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
Ttc21bQ0HA38 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Ttc21bQ0HA38 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Ttc21bQ0HA38 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
Ttc21bQ0HA38 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Ttc21bQ0HA38 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Ttc21bQ0HA38 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Ttc21bQ0HA38 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Ttc21bQ0HA38 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Ttc21bQ0HA38 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Ttc21bQ0HA38 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Ttc21bQ0HA38 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Ttc21bQ0HA38 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Ttc21bQ0HA38 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Ttc21bQ0HA38 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Ttc21bQ0HA38 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Ttc21bQ0HA38 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Ttc21bQ0HA38 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Ttc21bQ0HA38 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Ttc21bQ0HA38 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Ttc21bQ0HA38 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Ttc21bQ0HA38 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Ttc21bQ0HA38 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Ttc21bQ0HA38 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Ttc21bQ0HA38 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Ttc21bQ0HA38 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Ttc21bQ0HA38 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Ttc21bQ0HA38 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Ttc21bQ0HA38 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Ttc21bQ0HA38 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
Ttc21bQ0HA38 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Ttc21bQ0HA38 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
Ttc21bQ0HA38 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
Ttc21bQ0HA38 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
Ttc21bQ0HA38 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Ttc21bQ0HA38 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
Ttc21bQ0HA38 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Ttc21bQ0HA38 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Ttc21bQ0HA38 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Ttc21bQ0HA38 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
Ttc21bQ0HA38 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Ttc21bQ0HA38 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Ttc21bQ0HA38 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Ttc21bQ0HA38 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Ttc21bQ0HA38 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Ttc21bQ0HA38 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Ttc21bQ0HA38 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.7
Ttc21bQ0HA38 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Ttc21bQ0HA38 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Ttc21bQ0HA38 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Ttc21bQ0HA38 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Ttc21bQ0HA38 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
Ttc21bQ0HA38 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Ttc21bQ0HA38 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Ttc21bQ0HA38 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
Ttc21bQ0HA38 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Ttc21bQ0HA38 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Ttc21bQ0HA38 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Ttc21bQ0HA38 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Ttc21bQ0HA38 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Ttc21bQ0HA38 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Ttc21bQ0HA38 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Ttc21bQ0HA38 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Ttc21bQ0HA38 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC31.91■■■□□ 2.7
Ttc21bQ0HA38 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC31.91■■■□□ 2.7
Ttc21bQ0HA38 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Ttc21bQ0HA38 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
Ttc21bQ0HA38 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Ttc21bQ0HA38 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Ttc21bQ0HA38 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
Ttc21bQ0HA38 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Ttc21bQ0HA38 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
Ttc21bQ0HA38 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
Ttc21bQ0HA38 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Ttc21bQ0HA38 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Ttc21bQ0HA38 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
Ttc21bQ0HA38 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC31.88■■■□□ 2.69
Ttc21bQ0HA38 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC31.88■■■□□ 2.69
Ttc21bQ0HA38 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC31.88■■■□□ 2.69
Ttc21bQ0HA38 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Ttc21bQ0HA38 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.87■■■□□ 2.69
Ttc21bQ0HA38 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Ttc21bQ0HA38 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Ttc21bQ0HA38 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Ttc21bQ0HA38 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC31.86■■■□□ 2.69
Ttc21bQ0HA38 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Ttc21bQ0HA38 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC31.85■■■□□ 2.69
Ttc21bQ0HA38 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Ttc21bQ0HA38 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Ttc21bQ0HA38 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Ttc21bQ0HA38 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Ttc21bQ0HA38 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Ttc21bQ0HA38 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
Ttc21bQ0HA38 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Ttc21bQ0HA38 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Ttc21bQ0HA38 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC31.83■■■□□ 2.69
Ttc21bQ0HA38 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
Ttc21bQ0HA38 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Ttc21bQ0HA38 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms