Protein–RNA interactions for Protein: Q0GA42

Cnnm1, Metal transporter CNNM1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm1Q0GA42 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Cnnm1Q0GA42 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cnnm1Q0GA42 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cnnm1Q0GA42 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cnnm1Q0GA42 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cnnm1Q0GA42 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cnnm1Q0GA42 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cnnm1Q0GA42 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cnnm1Q0GA42 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cnnm1Q0GA42 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cnnm1Q0GA42 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cnnm1Q0GA42 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cnnm1Q0GA42 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cnnm1Q0GA42 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cnnm1Q0GA42 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cnnm1Q0GA42 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cnnm1Q0GA42 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cnnm1Q0GA42 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cnnm1Q0GA42 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cnnm1Q0GA42 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cnnm1Q0GA42 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cnnm1Q0GA42 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cnnm1Q0GA42 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cnnm1Q0GA42 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cnnm1Q0GA42 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Cnnm1Q0GA42 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cnnm1Q0GA42 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cnnm1Q0GA42 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cnnm1Q0GA42 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cnnm1Q0GA42 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cnnm1Q0GA42 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cnnm1Q0GA42 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cnnm1Q0GA42 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cnnm1Q0GA42 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cnnm1Q0GA42 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cnnm1Q0GA42 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cnnm1Q0GA42 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cnnm1Q0GA42 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cnnm1Q0GA42 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cnnm1Q0GA42 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cnnm1Q0GA42 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cnnm1Q0GA42 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cnnm1Q0GA42 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cnnm1Q0GA42 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cnnm1Q0GA42 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cnnm1Q0GA42 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cnnm1Q0GA42 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cnnm1Q0GA42 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cnnm1Q0GA42 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cnnm1Q0GA42 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cnnm1Q0GA42 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cnnm1Q0GA42 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cnnm1Q0GA42 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cnnm1Q0GA42 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Cnnm1Q0GA42 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cnnm1Q0GA42 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cnnm1Q0GA42 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cnnm1Q0GA42 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cnnm1Q0GA42 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cnnm1Q0GA42 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cnnm1Q0GA42 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cnnm1Q0GA42 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Cnnm1Q0GA42 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cnnm1Q0GA42 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cnnm1Q0GA42 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cnnm1Q0GA42 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Cnnm1Q0GA42 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cnnm1Q0GA42 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cnnm1Q0GA42 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cnnm1Q0GA42 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cnnm1Q0GA42 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cnnm1Q0GA42 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cnnm1Q0GA42 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cnnm1Q0GA42 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Cnnm1Q0GA42 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cnnm1Q0GA42 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cnnm1Q0GA42 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cnnm1Q0GA42 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cnnm1Q0GA42 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cnnm1Q0GA42 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cnnm1Q0GA42 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cnnm1Q0GA42 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cnnm1Q0GA42 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cnnm1Q0GA42 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Cnnm1Q0GA42 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cnnm1Q0GA42 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cnnm1Q0GA42 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Cnnm1Q0GA42 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cnnm1Q0GA42 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cnnm1Q0GA42 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cnnm1Q0GA42 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cnnm1Q0GA42 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Cnnm1Q0GA42 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Cnnm1Q0GA42 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cnnm1Q0GA42 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cnnm1Q0GA42 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cnnm1Q0GA42 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cnnm1Q0GA42 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cnnm1Q0GA42 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cnnm1Q0GA42 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms