Protein–RNA interactions for Protein: Q08EJ0

Plac8l1, PLAC8-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plac8l1Q08EJ0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Plac8l1Q08EJ0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Plac8l1Q08EJ0 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Plac8l1Q08EJ0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Plac8l1Q08EJ0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Plac8l1Q08EJ0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Plac8l1Q08EJ0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Plac8l1Q08EJ0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Plac8l1Q08EJ0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Plac8l1Q08EJ0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Plac8l1Q08EJ0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Plac8l1Q08EJ0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Plac8l1Q08EJ0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Plac8l1Q08EJ0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Plac8l1Q08EJ0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Plac8l1Q08EJ0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Plac8l1Q08EJ0 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Plac8l1Q08EJ0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Plac8l1Q08EJ0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Plac8l1Q08EJ0 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Plac8l1Q08EJ0 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Plac8l1Q08EJ0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Plac8l1Q08EJ0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Plac8l1Q08EJ0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Plac8l1Q08EJ0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Plac8l1Q08EJ0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Plac8l1Q08EJ0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Plac8l1Q08EJ0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Plac8l1Q08EJ0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Plac8l1Q08EJ0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Plac8l1Q08EJ0 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Plac8l1Q08EJ0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Plac8l1Q08EJ0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Plac8l1Q08EJ0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Plac8l1Q08EJ0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Plac8l1Q08EJ0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Plac8l1Q08EJ0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Plac8l1Q08EJ0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Plac8l1Q08EJ0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Plac8l1Q08EJ0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Plac8l1Q08EJ0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Plac8l1Q08EJ0 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Plac8l1Q08EJ0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Plac8l1Q08EJ0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Plac8l1Q08EJ0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Plac8l1Q08EJ0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Plac8l1Q08EJ0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Plac8l1Q08EJ0 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Plac8l1Q08EJ0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Plac8l1Q08EJ0 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Plac8l1Q08EJ0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Plac8l1Q08EJ0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Plac8l1Q08EJ0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Plac8l1Q08EJ0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Plac8l1Q08EJ0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Plac8l1Q08EJ0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Plac8l1Q08EJ0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Plac8l1Q08EJ0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Plac8l1Q08EJ0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Plac8l1Q08EJ0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Plac8l1Q08EJ0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Plac8l1Q08EJ0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Plac8l1Q08EJ0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Plac8l1Q08EJ0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Plac8l1Q08EJ0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Plac8l1Q08EJ0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Plac8l1Q08EJ0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Plac8l1Q08EJ0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Plac8l1Q08EJ0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Plac8l1Q08EJ0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Plac8l1Q08EJ0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Plac8l1Q08EJ0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Plac8l1Q08EJ0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Plac8l1Q08EJ0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Plac8l1Q08EJ0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Plac8l1Q08EJ0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Plac8l1Q08EJ0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Plac8l1Q08EJ0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Plac8l1Q08EJ0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Plac8l1Q08EJ0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Plac8l1Q08EJ0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Plac8l1Q08EJ0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Plac8l1Q08EJ0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Plac8l1Q08EJ0 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Plac8l1Q08EJ0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Plac8l1Q08EJ0 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Plac8l1Q08EJ0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Plac8l1Q08EJ0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Plac8l1Q08EJ0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Plac8l1Q08EJ0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Plac8l1Q08EJ0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Plac8l1Q08EJ0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Plac8l1Q08EJ0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Plac8l1Q08EJ0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Plac8l1Q08EJ0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Plac8l1Q08EJ0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Plac8l1Q08EJ0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Plac8l1Q08EJ0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Plac8l1Q08EJ0 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Plac8l1Q08EJ0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms