Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxc4Q08624 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hoxc4Q08624 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hoxc4Q08624 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hoxc4Q08624 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hoxc4Q08624 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hoxc4Q08624 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxc4Q08624 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxc4Q08624 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxc4Q08624 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxc4Q08624 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxc4Q08624 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxc4Q08624 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxc4Q08624 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxc4Q08624 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxc4Q08624 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxc4Q08624 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxc4Q08624 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxc4Q08624 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxc4Q08624 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxc4Q08624 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxc4Q08624 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxc4Q08624 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxc4Q08624 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxc4Q08624 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxc4Q08624 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxc4Q08624 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxc4Q08624 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxc4Q08624 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxc4Q08624 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxc4Q08624 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxc4Q08624 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxc4Q08624 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Hoxc4Q08624 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxc4Q08624 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxc4Q08624 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxc4Q08624 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxc4Q08624 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxc4Q08624 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxc4Q08624 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxc4Q08624 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxc4Q08624 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxc4Q08624 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxc4Q08624 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxc4Q08624 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxc4Q08624 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxc4Q08624 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxc4Q08624 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxc4Q08624 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxc4Q08624 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxc4Q08624 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxc4Q08624 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxc4Q08624 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxc4Q08624 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxc4Q08624 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxc4Q08624 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxc4Q08624 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxc4Q08624 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxc4Q08624 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxc4Q08624 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxc4Q08624 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxc4Q08624 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxc4Q08624 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxc4Q08624 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxc4Q08624 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxc4Q08624 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxc4Q08624 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxc4Q08624 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxc4Q08624 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxc4Q08624 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxc4Q08624 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxc4Q08624 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxc4Q08624 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxc4Q08624 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hoxc4Q08624 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxc4Q08624 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxc4Q08624 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxc4Q08624 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Hoxc4Q08624 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxc4Q08624 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxc4Q08624 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxc4Q08624 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxc4Q08624 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hoxc4Q08624 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxc4Q08624 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxc4Q08624 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxc4Q08624 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxc4Q08624 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hoxc4Q08624 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxc4Q08624 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxc4Q08624 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxc4Q08624 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxc4Q08624 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxc4Q08624 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxc4Q08624 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxc4Q08624 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hoxc4Q08624 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxc4Q08624 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxc4Q08624 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hoxc4Q08624 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms