Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Calb2Q08331 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Calb2Q08331 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Calb2Q08331 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Calb2Q08331 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Calb2Q08331 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Calb2Q08331 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Calb2Q08331 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Calb2Q08331 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Calb2Q08331 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Calb2Q08331 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Calb2Q08331 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Calb2Q08331 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Calb2Q08331 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Calb2Q08331 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Calb2Q08331 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Calb2Q08331 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Calb2Q08331 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Calb2Q08331 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Calb2Q08331 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Calb2Q08331 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Calb2Q08331 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Calb2Q08331 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Calb2Q08331 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Calb2Q08331 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Calb2Q08331 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Calb2Q08331 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Calb2Q08331 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Calb2Q08331 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Calb2Q08331 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Calb2Q08331 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Calb2Q08331 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Calb2Q08331 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Calb2Q08331 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Calb2Q08331 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Calb2Q08331 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Calb2Q08331 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Calb2Q08331 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Calb2Q08331 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Calb2Q08331 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Calb2Q08331 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Calb2Q08331 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Calb2Q08331 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Calb2Q08331 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Calb2Q08331 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Calb2Q08331 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Calb2Q08331 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Calb2Q08331 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Calb2Q08331 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Calb2Q08331 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Calb2Q08331 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Calb2Q08331 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Calb2Q08331 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Calb2Q08331 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Calb2Q08331 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Calb2Q08331 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Calb2Q08331 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Calb2Q08331 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Calb2Q08331 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Calb2Q08331 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Calb2Q08331 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Calb2Q08331 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Calb2Q08331 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Calb2Q08331 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Calb2Q08331 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Calb2Q08331 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Calb2Q08331 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Calb2Q08331 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Calb2Q08331 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Calb2Q08331 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Calb2Q08331 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Calb2Q08331 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Calb2Q08331 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Calb2Q08331 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Calb2Q08331 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Calb2Q08331 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Calb2Q08331 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Calb2Q08331 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Calb2Q08331 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Calb2Q08331 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Calb2Q08331 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Calb2Q08331 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Calb2Q08331 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Calb2Q08331 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Calb2Q08331 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Calb2Q08331 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Calb2Q08331 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Calb2Q08331 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Calb2Q08331 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Calb2Q08331 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Calb2Q08331 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Calb2Q08331 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Calb2Q08331 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Calb2Q08331 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Calb2Q08331 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Calb2Q08331 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Calb2Q08331 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Calb2Q08331 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Calb2Q08331 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Calb2Q08331 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms