Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gdf3Q07104 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gdf3Q07104 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gdf3Q07104 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gdf3Q07104 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gdf3Q07104 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gdf3Q07104 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gdf3Q07104 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gdf3Q07104 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gdf3Q07104 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gdf3Q07104 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gdf3Q07104 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gdf3Q07104 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gdf3Q07104 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gdf3Q07104 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gdf3Q07104 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gdf3Q07104 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gdf3Q07104 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gdf3Q07104 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gdf3Q07104 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gdf3Q07104 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gdf3Q07104 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gdf3Q07104 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gdf3Q07104 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gdf3Q07104 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gdf3Q07104 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Gdf3Q07104 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gdf3Q07104 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gdf3Q07104 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gdf3Q07104 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Gdf3Q07104 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gdf3Q07104 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gdf3Q07104 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gdf3Q07104 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gdf3Q07104 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gdf3Q07104 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gdf3Q07104 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gdf3Q07104 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gdf3Q07104 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gdf3Q07104 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gdf3Q07104 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gdf3Q07104 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gdf3Q07104 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gdf3Q07104 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gdf3Q07104 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gdf3Q07104 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gdf3Q07104 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gdf3Q07104 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gdf3Q07104 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gdf3Q07104 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gdf3Q07104 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gdf3Q07104 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gdf3Q07104 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Gdf3Q07104 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gdf3Q07104 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Gdf3Q07104 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gdf3Q07104 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gdf3Q07104 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gdf3Q07104 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gdf3Q07104 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gdf3Q07104 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gdf3Q07104 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gdf3Q07104 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gdf3Q07104 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gdf3Q07104 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gdf3Q07104 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gdf3Q07104 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gdf3Q07104 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gdf3Q07104 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gdf3Q07104 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gdf3Q07104 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gdf3Q07104 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gdf3Q07104 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gdf3Q07104 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gdf3Q07104 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gdf3Q07104 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gdf3Q07104 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gdf3Q07104 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gdf3Q07104 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gdf3Q07104 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gdf3Q07104 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gdf3Q07104 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gdf3Q07104 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gdf3Q07104 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gdf3Q07104 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gdf3Q07104 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gdf3Q07104 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gdf3Q07104 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gdf3Q07104 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gdf3Q07104 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gdf3Q07104 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gdf3Q07104 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gdf3Q07104 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gdf3Q07104 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gdf3Q07104 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gdf3Q07104 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gdf3Q07104 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gdf3Q07104 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gdf3Q07104 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gdf3Q07104 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms