Protein–RNA interactions for Protein: Q06831

Sox4, Transcription factor SOX-4, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox4Q06831 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sox4Q06831 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Sox4Q06831 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sox4Q06831 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sox4Q06831 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sox4Q06831 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sox4Q06831 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sox4Q06831 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sox4Q06831 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sox4Q06831 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sox4Q06831 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sox4Q06831 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sox4Q06831 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sox4Q06831 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sox4Q06831 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sox4Q06831 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sox4Q06831 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sox4Q06831 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sox4Q06831 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sox4Q06831 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sox4Q06831 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sox4Q06831 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sox4Q06831 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sox4Q06831 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sox4Q06831 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sox4Q06831 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sox4Q06831 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sox4Q06831 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sox4Q06831 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sox4Q06831 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sox4Q06831 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sox4Q06831 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sox4Q06831 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sox4Q06831 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sox4Q06831 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sox4Q06831 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sox4Q06831 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sox4Q06831 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sox4Q06831 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sox4Q06831 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Sox4Q06831 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sox4Q06831 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sox4Q06831 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sox4Q06831 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sox4Q06831 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sox4Q06831 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sox4Q06831 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sox4Q06831 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sox4Q06831 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sox4Q06831 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sox4Q06831 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sox4Q06831 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sox4Q06831 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sox4Q06831 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sox4Q06831 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sox4Q06831 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sox4Q06831 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sox4Q06831 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sox4Q06831 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sox4Q06831 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sox4Q06831 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sox4Q06831 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sox4Q06831 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Sox4Q06831 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sox4Q06831 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sox4Q06831 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sox4Q06831 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sox4Q06831 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sox4Q06831 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sox4Q06831 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sox4Q06831 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sox4Q06831 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sox4Q06831 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sox4Q06831 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sox4Q06831 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sox4Q06831 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sox4Q06831 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sox4Q06831 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Sox4Q06831 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sox4Q06831 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sox4Q06831 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sox4Q06831 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sox4Q06831 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sox4Q06831 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sox4Q06831 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sox4Q06831 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Sox4Q06831 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sox4Q06831 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sox4Q06831 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sox4Q06831 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Sox4Q06831 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sox4Q06831 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sox4Q06831 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sox4Q06831 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sox4Q06831 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sox4Q06831 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sox4Q06831 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sox4Q06831 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sox4Q06831 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sox4Q06831 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms