Protein–RNA interactions for Protein: Q06666

Srst, Octapeptide-repeat protein T2, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrstQ06666 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SrstQ06666 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SrstQ06666 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SrstQ06666 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SrstQ06666 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SrstQ06666 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SrstQ06666 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SrstQ06666 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SrstQ06666 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SrstQ06666 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SrstQ06666 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SrstQ06666 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SrstQ06666 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SrstQ06666 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SrstQ06666 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SrstQ06666 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SrstQ06666 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SrstQ06666 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SrstQ06666 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SrstQ06666 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SrstQ06666 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SrstQ06666 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SrstQ06666 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SrstQ06666 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SrstQ06666 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SrstQ06666 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SrstQ06666 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SrstQ06666 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SrstQ06666 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SrstQ06666 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SrstQ06666 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SrstQ06666 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SrstQ06666 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SrstQ06666 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SrstQ06666 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SrstQ06666 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SrstQ06666 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SrstQ06666 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SrstQ06666 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SrstQ06666 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SrstQ06666 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SrstQ06666 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SrstQ06666 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SrstQ06666 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SrstQ06666 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SrstQ06666 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SrstQ06666 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SrstQ06666 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SrstQ06666 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SrstQ06666 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SrstQ06666 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SrstQ06666 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SrstQ06666 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SrstQ06666 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SrstQ06666 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SrstQ06666 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SrstQ06666 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SrstQ06666 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SrstQ06666 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SrstQ06666 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SrstQ06666 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SrstQ06666 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SrstQ06666 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SrstQ06666 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SrstQ06666 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SrstQ06666 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SrstQ06666 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SrstQ06666 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SrstQ06666 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SrstQ06666 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SrstQ06666 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SrstQ06666 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SrstQ06666 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SrstQ06666 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SrstQ06666 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SrstQ06666 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SrstQ06666 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SrstQ06666 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SrstQ06666 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SrstQ06666 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SrstQ06666 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SrstQ06666 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SrstQ06666 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SrstQ06666 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SrstQ06666 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SrstQ06666 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SrstQ06666 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SrstQ06666 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SrstQ06666 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SrstQ06666 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SrstQ06666 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SrstQ06666 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SrstQ06666 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SrstQ06666 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SrstQ06666 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SrstQ06666 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SrstQ06666 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SrstQ06666 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SrstQ06666 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SrstQ06666 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms