Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sh3bp2Q06649 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sh3bp2Q06649 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sh3bp2Q06649 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sh3bp2Q06649 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Sh3bp2Q06649 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sh3bp2Q06649 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sh3bp2Q06649 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sh3bp2Q06649 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sh3bp2Q06649 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sh3bp2Q06649 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sh3bp2Q06649 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sh3bp2Q06649 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sh3bp2Q06649 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sh3bp2Q06649 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sh3bp2Q06649 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sh3bp2Q06649 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sh3bp2Q06649 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Sh3bp2Q06649 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sh3bp2Q06649 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sh3bp2Q06649 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sh3bp2Q06649 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sh3bp2Q06649 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sh3bp2Q06649 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sh3bp2Q06649 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sh3bp2Q06649 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sh3bp2Q06649 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sh3bp2Q06649 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Sh3bp2Q06649 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sh3bp2Q06649 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sh3bp2Q06649 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sh3bp2Q06649 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Sh3bp2Q06649 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sh3bp2Q06649 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sh3bp2Q06649 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sh3bp2Q06649 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sh3bp2Q06649 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Sh3bp2Q06649 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sh3bp2Q06649 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sh3bp2Q06649 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sh3bp2Q06649 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sh3bp2Q06649 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sh3bp2Q06649 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sh3bp2Q06649 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sh3bp2Q06649 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sh3bp2Q06649 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sh3bp2Q06649 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Sh3bp2Q06649 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sh3bp2Q06649 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sh3bp2Q06649 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sh3bp2Q06649 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sh3bp2Q06649 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sh3bp2Q06649 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sh3bp2Q06649 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sh3bp2Q06649 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sh3bp2Q06649 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sh3bp2Q06649 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sh3bp2Q06649 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sh3bp2Q06649 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sh3bp2Q06649 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sh3bp2Q06649 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sh3bp2Q06649 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sh3bp2Q06649 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sh3bp2Q06649 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sh3bp2Q06649 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sh3bp2Q06649 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sh3bp2Q06649 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sh3bp2Q06649 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sh3bp2Q06649 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sh3bp2Q06649 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sh3bp2Q06649 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sh3bp2Q06649 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sh3bp2Q06649 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sh3bp2Q06649 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sh3bp2Q06649 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sh3bp2Q06649 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sh3bp2Q06649 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Sh3bp2Q06649 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sh3bp2Q06649 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sh3bp2Q06649 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sh3bp2Q06649 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sh3bp2Q06649 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sh3bp2Q06649 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sh3bp2Q06649 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sh3bp2Q06649 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sh3bp2Q06649 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sh3bp2Q06649 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sh3bp2Q06649 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sh3bp2Q06649 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sh3bp2Q06649 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sh3bp2Q06649 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sh3bp2Q06649 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sh3bp2Q06649 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sh3bp2Q06649 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sh3bp2Q06649 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sh3bp2Q06649 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sh3bp2Q06649 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sh3bp2Q06649 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sh3bp2Q06649 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sh3bp2Q06649 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms