Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Apoc2Q05020 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Apoc2Q05020 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Apoc2Q05020 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Apoc2Q05020 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Apoc2Q05020 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Apoc2Q05020 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Apoc2Q05020 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Apoc2Q05020 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Apoc2Q05020 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Apoc2Q05020 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Apoc2Q05020 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Apoc2Q05020 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Apoc2Q05020 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Apoc2Q05020 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Apoc2Q05020 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Apoc2Q05020 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Apoc2Q05020 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Apoc2Q05020 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Apoc2Q05020 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Apoc2Q05020 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Apoc2Q05020 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Apoc2Q05020 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Apoc2Q05020 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Apoc2Q05020 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Apoc2Q05020 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Apoc2Q05020 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Apoc2Q05020 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Apoc2Q05020 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Apoc2Q05020 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Apoc2Q05020 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Apoc2Q05020 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Apoc2Q05020 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Apoc2Q05020 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Apoc2Q05020 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Apoc2Q05020 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Apoc2Q05020 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Apoc2Q05020 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Apoc2Q05020 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Apoc2Q05020 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Apoc2Q05020 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Apoc2Q05020 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Apoc2Q05020 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Apoc2Q05020 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Apoc2Q05020 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Apoc2Q05020 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Apoc2Q05020 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Apoc2Q05020 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Apoc2Q05020 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Apoc2Q05020 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Apoc2Q05020 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Apoc2Q05020 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Apoc2Q05020 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Apoc2Q05020 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Apoc2Q05020 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Apoc2Q05020 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Apoc2Q05020 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Apoc2Q05020 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Apoc2Q05020 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Apoc2Q05020 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Apoc2Q05020 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Apoc2Q05020 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Apoc2Q05020 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Apoc2Q05020 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Apoc2Q05020 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Apoc2Q05020 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Apoc2Q05020 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Apoc2Q05020 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Apoc2Q05020 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Apoc2Q05020 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Apoc2Q05020 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Apoc2Q05020 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Apoc2Q05020 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Apoc2Q05020 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Apoc2Q05020 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Apoc2Q05020 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Apoc2Q05020 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Apoc2Q05020 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Apoc2Q05020 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Apoc2Q05020 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Apoc2Q05020 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Apoc2Q05020 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Apoc2Q05020 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Apoc2Q05020 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Apoc2Q05020 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Apoc2Q05020 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Apoc2Q05020 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Apoc2Q05020 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Apoc2Q05020 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Apoc2Q05020 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Apoc2Q05020 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Apoc2Q05020 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Apoc2Q05020 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Apoc2Q05020 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Apoc2Q05020 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Apoc2Q05020 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Apoc2Q05020 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Apoc2Q05020 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Apoc2Q05020 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Apoc2Q05020 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms