Protein–RNA interactions for Protein: Q04899

Cdk18, Cyclin-dependent kinase 18, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk18Q04899 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdk18Q04899 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdk18Q04899 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdk18Q04899 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cdk18Q04899 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cdk18Q04899 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cdk18Q04899 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cdk18Q04899 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cdk18Q04899 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdk18Q04899 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdk18Q04899 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdk18Q04899 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdk18Q04899 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdk18Q04899 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cdk18Q04899 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cdk18Q04899 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cdk18Q04899 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cdk18Q04899 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Cdk18Q04899 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cdk18Q04899 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cdk18Q04899 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cdk18Q04899 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdk18Q04899 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdk18Q04899 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdk18Q04899 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdk18Q04899 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdk18Q04899 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cdk18Q04899 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cdk18Q04899 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdk18Q04899 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdk18Q04899 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdk18Q04899 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdk18Q04899 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdk18Q04899 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdk18Q04899 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdk18Q04899 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cdk18Q04899 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdk18Q04899 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdk18Q04899 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdk18Q04899 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdk18Q04899 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cdk18Q04899 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdk18Q04899 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Cdk18Q04899 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdk18Q04899 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdk18Q04899 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdk18Q04899 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdk18Q04899 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdk18Q04899 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdk18Q04899 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdk18Q04899 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdk18Q04899 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdk18Q04899 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cdk18Q04899 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdk18Q04899 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdk18Q04899 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cdk18Q04899 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cdk18Q04899 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cdk18Q04899 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cdk18Q04899 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cdk18Q04899 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdk18Q04899 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdk18Q04899 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdk18Q04899 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdk18Q04899 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdk18Q04899 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdk18Q04899 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdk18Q04899 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdk18Q04899 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdk18Q04899 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cdk18Q04899 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdk18Q04899 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdk18Q04899 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdk18Q04899 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdk18Q04899 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdk18Q04899 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cdk18Q04899 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdk18Q04899 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdk18Q04899 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cdk18Q04899 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdk18Q04899 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdk18Q04899 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdk18Q04899 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdk18Q04899 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cdk18Q04899 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdk18Q04899 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdk18Q04899 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdk18Q04899 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdk18Q04899 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdk18Q04899 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdk18Q04899 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdk18Q04899 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdk18Q04899 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdk18Q04899 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdk18Q04899 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdk18Q04899 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cdk18Q04899 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cdk18Q04899 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cdk18Q04899 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cdk18Q04899 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms