Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Sox8Q04886 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sox8Q04886 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sox8Q04886 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sox8Q04886 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sox8Q04886 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sox8Q04886 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sox8Q04886 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sox8Q04886 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sox8Q04886 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sox8Q04886 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sox8Q04886 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sox8Q04886 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sox8Q04886 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sox8Q04886 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sox8Q04886 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sox8Q04886 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sox8Q04886 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sox8Q04886 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sox8Q04886 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sox8Q04886 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sox8Q04886 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sox8Q04886 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sox8Q04886 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sox8Q04886 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sox8Q04886 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sox8Q04886 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sox8Q04886 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sox8Q04886 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sox8Q04886 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sox8Q04886 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sox8Q04886 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sox8Q04886 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sox8Q04886 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sox8Q04886 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sox8Q04886 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sox8Q04886 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Sox8Q04886 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sox8Q04886 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sox8Q04886 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sox8Q04886 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sox8Q04886 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sox8Q04886 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Sox8Q04886 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sox8Q04886 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sox8Q04886 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sox8Q04886 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sox8Q04886 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sox8Q04886 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sox8Q04886 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sox8Q04886 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sox8Q04886 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sox8Q04886 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sox8Q04886 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sox8Q04886 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sox8Q04886 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sox8Q04886 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sox8Q04886 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sox8Q04886 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sox8Q04886 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sox8Q04886 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sox8Q04886 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sox8Q04886 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sox8Q04886 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sox8Q04886 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Sox8Q04886 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sox8Q04886 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sox8Q04886 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sox8Q04886 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sox8Q04886 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sox8Q04886 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sox8Q04886 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sox8Q04886 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sox8Q04886 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sox8Q04886 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sox8Q04886 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sox8Q04886 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sox8Q04886 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sox8Q04886 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sox8Q04886 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sox8Q04886 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sox8Q04886 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sox8Q04886 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sox8Q04886 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sox8Q04886 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sox8Q04886 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sox8Q04886 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sox8Q04886 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sox8Q04886 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sox8Q04886 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sox8Q04886 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sox8Q04886 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sox8Q04886 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sox8Q04886 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sox8Q04886 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sox8Q04886 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sox8Q04886 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sox8Q04886 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sox8Q04886 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Sox8Q04886 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms