Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cxcr5Q04683 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cxcr5Q04683 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cxcr5Q04683 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cxcr5Q04683 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cxcr5Q04683 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cxcr5Q04683 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cxcr5Q04683 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cxcr5Q04683 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cxcr5Q04683 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cxcr5Q04683 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cxcr5Q04683 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cxcr5Q04683 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cxcr5Q04683 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cxcr5Q04683 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cxcr5Q04683 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cxcr5Q04683 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Cxcr5Q04683 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Cxcr5Q04683 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Cxcr5Q04683 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cxcr5Q04683 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cxcr5Q04683 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Cxcr5Q04683 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cxcr5Q04683 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Cxcr5Q04683 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Cxcr5Q04683 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cxcr5Q04683 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cxcr5Q04683 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Cxcr5Q04683 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cxcr5Q04683 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cxcr5Q04683 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cxcr5Q04683 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cxcr5Q04683 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cxcr5Q04683 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cxcr5Q04683 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cxcr5Q04683 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Cxcr5Q04683 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Cxcr5Q04683 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cxcr5Q04683 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cxcr5Q04683 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cxcr5Q04683 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cxcr5Q04683 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cxcr5Q04683 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cxcr5Q04683 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cxcr5Q04683 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cxcr5Q04683 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cxcr5Q04683 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cxcr5Q04683 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cxcr5Q04683 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cxcr5Q04683 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cxcr5Q04683 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cxcr5Q04683 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cxcr5Q04683 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cxcr5Q04683 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cxcr5Q04683 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cxcr5Q04683 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Cxcr5Q04683 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Cxcr5Q04683 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cxcr5Q04683 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cxcr5Q04683 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cxcr5Q04683 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cxcr5Q04683 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cxcr5Q04683 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cxcr5Q04683 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cxcr5Q04683 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cxcr5Q04683 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cxcr5Q04683 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cxcr5Q04683 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Cxcr5Q04683 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cxcr5Q04683 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cxcr5Q04683 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cxcr5Q04683 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cxcr5Q04683 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cxcr5Q04683 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Cxcr5Q04683 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cxcr5Q04683 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cxcr5Q04683 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cxcr5Q04683 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Cxcr5Q04683 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Cxcr5Q04683 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Cxcr5Q04683 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cxcr5Q04683 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cxcr5Q04683 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cxcr5Q04683 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cxcr5Q04683 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cxcr5Q04683 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cxcr5Q04683 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cxcr5Q04683 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cxcr5Q04683 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cxcr5Q04683 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Cxcr5Q04683 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cxcr5Q04683 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cxcr5Q04683 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cxcr5Q04683 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Cxcr5Q04683 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cxcr5Q04683 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cxcr5Q04683 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cxcr5Q04683 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cxcr5Q04683 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cxcr5Q04683 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms