Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tff2Q03404 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tff2Q03404 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tff2Q03404 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tff2Q03404 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tff2Q03404 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tff2Q03404 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Tff2Q03404 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tff2Q03404 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tff2Q03404 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tff2Q03404 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tff2Q03404 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Tff2Q03404 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tff2Q03404 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tff2Q03404 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tff2Q03404 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tff2Q03404 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tff2Q03404 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tff2Q03404 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tff2Q03404 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Tff2Q03404 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tff2Q03404 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tff2Q03404 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tff2Q03404 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tff2Q03404 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tff2Q03404 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tff2Q03404 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tff2Q03404 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tff2Q03404 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Tff2Q03404 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Tff2Q03404 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tff2Q03404 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tff2Q03404 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tff2Q03404 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tff2Q03404 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tff2Q03404 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tff2Q03404 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tff2Q03404 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tff2Q03404 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tff2Q03404 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tff2Q03404 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Tff2Q03404 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tff2Q03404 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tff2Q03404 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tff2Q03404 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tff2Q03404 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tff2Q03404 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tff2Q03404 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tff2Q03404 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tff2Q03404 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tff2Q03404 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tff2Q03404 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tff2Q03404 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tff2Q03404 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tff2Q03404 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tff2Q03404 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tff2Q03404 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tff2Q03404 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tff2Q03404 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tff2Q03404 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tff2Q03404 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Tff2Q03404 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tff2Q03404 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tff2Q03404 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tff2Q03404 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tff2Q03404 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tff2Q03404 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tff2Q03404 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tff2Q03404 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tff2Q03404 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tff2Q03404 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tff2Q03404 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tff2Q03404 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tff2Q03404 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tff2Q03404 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tff2Q03404 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tff2Q03404 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tff2Q03404 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tff2Q03404 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Tff2Q03404 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tff2Q03404 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tff2Q03404 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tff2Q03404 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tff2Q03404 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tff2Q03404 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tff2Q03404 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tff2Q03404 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tff2Q03404 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tff2Q03404 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tff2Q03404 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tff2Q03404 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tff2Q03404 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tff2Q03404 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tff2Q03404 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tff2Q03404 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Tff2Q03404 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tff2Q03404 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tff2Q03404 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tff2Q03404 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tff2Q03404 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms