Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccl7Q03366 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccl7Q03366 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccl7Q03366 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccl7Q03366 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccl7Q03366 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccl7Q03366 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccl7Q03366 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccl7Q03366 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccl7Q03366 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccl7Q03366 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccl7Q03366 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccl7Q03366 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccl7Q03366 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccl7Q03366 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccl7Q03366 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccl7Q03366 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccl7Q03366 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccl7Q03366 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccl7Q03366 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccl7Q03366 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccl7Q03366 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccl7Q03366 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccl7Q03366 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccl7Q03366 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccl7Q03366 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccl7Q03366 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccl7Q03366 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccl7Q03366 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccl7Q03366 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccl7Q03366 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccl7Q03366 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccl7Q03366 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccl7Q03366 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccl7Q03366 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccl7Q03366 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccl7Q03366 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccl7Q03366 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccl7Q03366 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccl7Q03366 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccl7Q03366 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccl7Q03366 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccl7Q03366 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccl7Q03366 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccl7Q03366 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccl7Q03366 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccl7Q03366 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccl7Q03366 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccl7Q03366 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccl7Q03366 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccl7Q03366 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccl7Q03366 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccl7Q03366 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccl7Q03366 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccl7Q03366 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccl7Q03366 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccl7Q03366 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccl7Q03366 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccl7Q03366 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccl7Q03366 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccl7Q03366 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccl7Q03366 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccl7Q03366 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccl7Q03366 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccl7Q03366 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccl7Q03366 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccl7Q03366 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccl7Q03366 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccl7Q03366 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccl7Q03366 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccl7Q03366 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccl7Q03366 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccl7Q03366 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccl7Q03366 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccl7Q03366 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccl7Q03366 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccl7Q03366 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccl7Q03366 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccl7Q03366 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccl7Q03366 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccl7Q03366 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccl7Q03366 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccl7Q03366 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccl7Q03366 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccl7Q03366 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccl7Q03366 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccl7Q03366 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccl7Q03366 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccl7Q03366 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccl7Q03366 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccl7Q03366 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccl7Q03366 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccl7Q03366 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccl7Q03366 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccl7Q03366 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccl7Q03366 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccl7Q03366 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccl7Q03366 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccl7Q03366 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccl7Q03366 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.4 ms