Protein–RNA interactions for Protein: Q03265

Atp5a1, ATP synthase subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5a1Q03265 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atp5a1Q03265 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atp5a1Q03265 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atp5a1Q03265 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atp5a1Q03265 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atp5a1Q03265 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atp5a1Q03265 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atp5a1Q03265 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atp5a1Q03265 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atp5a1Q03265 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atp5a1Q03265 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atp5a1Q03265 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atp5a1Q03265 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atp5a1Q03265 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atp5a1Q03265 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atp5a1Q03265 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atp5a1Q03265 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atp5a1Q03265 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atp5a1Q03265 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atp5a1Q03265 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atp5a1Q03265 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atp5a1Q03265 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atp5a1Q03265 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atp5a1Q03265 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atp5a1Q03265 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atp5a1Q03265 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atp5a1Q03265 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atp5a1Q03265 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atp5a1Q03265 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atp5a1Q03265 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atp5a1Q03265 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Atp5a1Q03265 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atp5a1Q03265 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Atp5a1Q03265 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Atp5a1Q03265 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Atp5a1Q03265 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Atp5a1Q03265 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atp5a1Q03265 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atp5a1Q03265 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Atp5a1Q03265 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atp5a1Q03265 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Atp5a1Q03265 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atp5a1Q03265 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atp5a1Q03265 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atp5a1Q03265 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atp5a1Q03265 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Atp5a1Q03265 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atp5a1Q03265 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atp5a1Q03265 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atp5a1Q03265 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atp5a1Q03265 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atp5a1Q03265 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Atp5a1Q03265 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atp5a1Q03265 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atp5a1Q03265 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atp5a1Q03265 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atp5a1Q03265 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atp5a1Q03265 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atp5a1Q03265 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atp5a1Q03265 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Atp5a1Q03265 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Atp5a1Q03265 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Atp5a1Q03265 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Atp5a1Q03265 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Atp5a1Q03265 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Atp5a1Q03265 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Atp5a1Q03265 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Atp5a1Q03265 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atp5a1Q03265 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atp5a1Q03265 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Atp5a1Q03265 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Atp5a1Q03265 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atp5a1Q03265 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atp5a1Q03265 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atp5a1Q03265 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atp5a1Q03265 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atp5a1Q03265 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atp5a1Q03265 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atp5a1Q03265 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atp5a1Q03265 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Atp5a1Q03265 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atp5a1Q03265 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atp5a1Q03265 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atp5a1Q03265 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Atp5a1Q03265 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Atp5a1Q03265 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atp5a1Q03265 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atp5a1Q03265 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atp5a1Q03265 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Atp5a1Q03265 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Atp5a1Q03265 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atp5a1Q03265 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atp5a1Q03265 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atp5a1Q03265 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atp5a1Q03265 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atp5a1Q03265 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atp5a1Q03265 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atp5a1Q03265 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atp5a1Q03265 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atp5a1Q03265 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms