Protein–RNA interactions for Protein: Q03147

Cdk7, Cyclin-dependent kinase 7, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk7Q03147 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdk7Q03147 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdk7Q03147 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cdk7Q03147 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cdk7Q03147 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cdk7Q03147 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cdk7Q03147 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdk7Q03147 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdk7Q03147 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdk7Q03147 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdk7Q03147 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cdk7Q03147 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdk7Q03147 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdk7Q03147 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdk7Q03147 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cdk7Q03147 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdk7Q03147 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cdk7Q03147 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdk7Q03147 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdk7Q03147 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdk7Q03147 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdk7Q03147 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdk7Q03147 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cdk7Q03147 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdk7Q03147 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdk7Q03147 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdk7Q03147 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdk7Q03147 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdk7Q03147 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cdk7Q03147 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdk7Q03147 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdk7Q03147 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cdk7Q03147 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdk7Q03147 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdk7Q03147 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cdk7Q03147 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cdk7Q03147 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdk7Q03147 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdk7Q03147 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdk7Q03147 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdk7Q03147 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdk7Q03147 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdk7Q03147 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdk7Q03147 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdk7Q03147 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdk7Q03147 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdk7Q03147 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdk7Q03147 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdk7Q03147 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdk7Q03147 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdk7Q03147 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdk7Q03147 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdk7Q03147 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdk7Q03147 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdk7Q03147 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdk7Q03147 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdk7Q03147 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdk7Q03147 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdk7Q03147 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdk7Q03147 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdk7Q03147 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdk7Q03147 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdk7Q03147 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdk7Q03147 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdk7Q03147 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdk7Q03147 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdk7Q03147 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdk7Q03147 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdk7Q03147 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdk7Q03147 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdk7Q03147 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdk7Q03147 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdk7Q03147 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdk7Q03147 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdk7Q03147 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdk7Q03147 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdk7Q03147 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdk7Q03147 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdk7Q03147 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdk7Q03147 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdk7Q03147 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdk7Q03147 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdk7Q03147 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdk7Q03147 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdk7Q03147 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdk7Q03147 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdk7Q03147 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdk7Q03147 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdk7Q03147 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdk7Q03147 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdk7Q03147 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdk7Q03147 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdk7Q03147 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdk7Q03147 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdk7Q03147 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdk7Q03147 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdk7Q03147 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdk7Q03147 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdk7Q03147 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdk7Q03147 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms