Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gjb5Q02739 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gjb5Q02739 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gjb5Q02739 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gjb5Q02739 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gjb5Q02739 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gjb5Q02739 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gjb5Q02739 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gjb5Q02739 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gjb5Q02739 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gjb5Q02739 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gjb5Q02739 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gjb5Q02739 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gjb5Q02739 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gjb5Q02739 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gjb5Q02739 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gjb5Q02739 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gjb5Q02739 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gjb5Q02739 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gjb5Q02739 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gjb5Q02739 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gjb5Q02739 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gjb5Q02739 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gjb5Q02739 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gjb5Q02739 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gjb5Q02739 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gjb5Q02739 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gjb5Q02739 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Gjb5Q02739 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gjb5Q02739 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gjb5Q02739 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gjb5Q02739 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gjb5Q02739 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Gjb5Q02739 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gjb5Q02739 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gjb5Q02739 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gjb5Q02739 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gjb5Q02739 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gjb5Q02739 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gjb5Q02739 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Gjb5Q02739 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gjb5Q02739 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gjb5Q02739 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gjb5Q02739 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gjb5Q02739 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gjb5Q02739 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gjb5Q02739 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Gjb5Q02739 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gjb5Q02739 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gjb5Q02739 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gjb5Q02739 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gjb5Q02739 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gjb5Q02739 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gjb5Q02739 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gjb5Q02739 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gjb5Q02739 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Gjb5Q02739 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gjb5Q02739 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gjb5Q02739 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gjb5Q02739 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gjb5Q02739 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gjb5Q02739 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gjb5Q02739 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gjb5Q02739 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gjb5Q02739 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gjb5Q02739 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gjb5Q02739 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gjb5Q02739 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gjb5Q02739 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gjb5Q02739 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gjb5Q02739 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gjb5Q02739 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gjb5Q02739 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gjb5Q02739 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gjb5Q02739 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gjb5Q02739 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gjb5Q02739 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gjb5Q02739 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gjb5Q02739 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Gjb5Q02739 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gjb5Q02739 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gjb5Q02739 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gjb5Q02739 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gjb5Q02739 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gjb5Q02739 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gjb5Q02739 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gjb5Q02739 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gjb5Q02739 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gjb5Q02739 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gjb5Q02739 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gjb5Q02739 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gjb5Q02739 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gjb5Q02739 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gjb5Q02739 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gjb5Q02739 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gjb5Q02739 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gjb5Q02739 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gjb5Q02739 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gjb5Q02739 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gjb5Q02739 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81 ms