Protein–RNA interactions for Protein: Q01965

Ly9, T-lymphocyte surface antigen Ly-9, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly9Q01965 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ly9Q01965 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ly9Q01965 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ly9Q01965 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ly9Q01965 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ly9Q01965 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Ly9Q01965 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ly9Q01965 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ly9Q01965 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ly9Q01965 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ly9Q01965 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ly9Q01965 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ly9Q01965 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ly9Q01965 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ly9Q01965 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ly9Q01965 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ly9Q01965 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ly9Q01965 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ly9Q01965 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ly9Q01965 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ly9Q01965 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ly9Q01965 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ly9Q01965 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ly9Q01965 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ly9Q01965 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ly9Q01965 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ly9Q01965 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ly9Q01965 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ly9Q01965 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ly9Q01965 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ly9Q01965 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ly9Q01965 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ly9Q01965 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ly9Q01965 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ly9Q01965 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ly9Q01965 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ly9Q01965 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ly9Q01965 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ly9Q01965 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ly9Q01965 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ly9Q01965 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ly9Q01965 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ly9Q01965 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ly9Q01965 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ly9Q01965 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ly9Q01965 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ly9Q01965 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ly9Q01965 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ly9Q01965 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ly9Q01965 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ly9Q01965 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ly9Q01965 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ly9Q01965 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ly9Q01965 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ly9Q01965 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Ly9Q01965 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ly9Q01965 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Ly9Q01965 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ly9Q01965 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Ly9Q01965 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ly9Q01965 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ly9Q01965 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ly9Q01965 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ly9Q01965 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ly9Q01965 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Ly9Q01965 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ly9Q01965 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ly9Q01965 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ly9Q01965 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ly9Q01965 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ly9Q01965 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ly9Q01965 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ly9Q01965 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ly9Q01965 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ly9Q01965 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ly9Q01965 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ly9Q01965 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ly9Q01965 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ly9Q01965 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ly9Q01965 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ly9Q01965 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ly9Q01965 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ly9Q01965 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ly9Q01965 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ly9Q01965 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ly9Q01965 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ly9Q01965 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ly9Q01965 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ly9Q01965 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ly9Q01965 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ly9Q01965 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ly9Q01965 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Ly9Q01965 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ly9Q01965 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ly9Q01965 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ly9Q01965 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ly9Q01965 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ly9Q01965 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ly9Q01965 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ly9Q01965 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms